Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SMOC1

SPARC related modular calcium binding 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
14q24.1
Koordinaadid
Kromosoom 14: 69 879 416–70 032 366 (GRCh38)
Eksonid
12 eksonit, ulatus 153 kb
Valk
435 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000361956.8NM_001034852.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SMOC1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SMOC1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 14, millel on sulg kohal, kus asub SMOC1. SMOC1 ja sellele lähedal asuvad 11 geeni kromosoomil 14, vahemikus 69 455 891 kuni 70 455 890.Kromosoom 1414q24.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3369,6 Mb69,8 Mb70 Mb70,2 Mb70,4 MbSLC39A9: 69 398 015–69 463 644, otsene ahelSLC39A9PLEKHD1: 69 484 692–69 531 551, otsene ahelPLEKHD1CCDC177: 69 569 498–69 574 890, pöördne ahelCCDC177SUSD6: 69 611 567–69 715 144, otsene ahelSUSD6SRSF5: 69 726 822–69 773 904, otsene ahelSRSF5SLC10A1: 69 768 055–69 797 665, pöördne ahelSLC10A1SMOC1: 69 879 416–70 032 366, otsene ahelSMOC1SLC8A3: 70 044 215–70 189 480, pöördne ahelSLC8A3COX16: 70 325 081–70 416 984, pöördne ahelCOX16SYNJ2BP-COX16: 70 326 064–70 417 074, pöördne ahelSYNJ2BP-COX16SYNJ2BP: 70 366 499–70 417 102, pöördne ahelSYNJ2BPADAM21: 70 417 107–70 460 453, otsene ahelADAM21SMOC1 skeem: 12 eksonit kromosoomi 14 otsene ahelalEkson 2: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 69 879 416–69 879 777, 362 alustEkson 2: 69 952 138–69 952 303, 166 alustEkson 3: 69 953 420–69 953 532, 113 alustEkson 4: 69 975 715–69 975 814, 100 alustEkson 5: 69 977 918–69 977 965, 48 alustEkson 6: 69 992 417–69 992 473, 57 alustEkson 7: 69 994 400–69 994 480, 81 alustEkson 8: 70 010 754–70 010 946, 193 alustEkson 9: 70 011 485–70 011 567, 83 alustEkson 10: 70 013 386–70 013 491, 106 alustEkson 11: 70 023 203–70 023 447, 245 alustEkson 12: 70 030 242–70 032 366, 2125 alust1510125′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,7 kb kogupikkusega 153 kb; neist 1308 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse SMOC1

4

kohad geenis SMOC1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SMOC1 153 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,7 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SMOC1 geen: SPARC related modular calcium binding 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/smoc1

Vancouver

Dante Labs. SMOC1 geen: SPARC related modular calcium binding 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/smoc1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test