Geeni
PURA
purine rich element binding protein A
- HGNC 9701↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000185129↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5813↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 5q31.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 5: 140 114 109–140 125 619 (GRCh38)
- Eksonit
- 1 eksoni 11,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 322 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- PURALPHA, PUR1, PUR-ALPHA
- MANE Select -transkripti
- ENST00000331327.5NM_005859.5
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pura.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue PURA ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä PURA. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.
PURA-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 11,5 kb geenin 11,5 kb:stä; 969 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: PURA
2Matala
Kuinka vaikea PURA on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100Jokainen palkki kuvaa sen osuutta PURA-geenin eksonien emäksistä kyseisessä vaikeassa alueessa. Pisteet painottavat alueita sen mukaan, kuinka paljon kukin vaikeuttaa lyhyiden lukemien variantinkutsua: 0, kun mikään emäs ei kuulu mihinkään vaikeaan alueeseen, ja 100, kun jokainen emäs kuuluu kaikkiin niistä.
- KartoitettavuusAlueet, joilla 100 tai 250 emäsparin lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten kutsu siellä voi puuttua tai olla virheellinen. Paino 35 %.0,2 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatit: kopiot muualla genomissa, kuten paraloogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identtisyydellä. Paino 30 %.0 %
- ToistotTandeemitoistot ja saman emäksen toistuvat jaksot, joilla lukemat luistavat ja joita ne eivät välttämättä kata. Paino 15 %.7,3 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emästen osuus on alle 25 % tai yli 65 %, ja joita kirjastonvalmistus kattaa ohuesti. Paino 10 %.11 %
- Referenssin peittävyysLähellä olevan referenssikokoonpanon aukot, joissa ei ole sekvenssiä, johon lukemat voisivat kohdistua. Paino 10 %.0 %
115
kohtaa PURA-geenissä, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Yksikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 11,5 kb PURA-geenistä, intronit mukaan lukien, eikä vain 11,5 kb eksoneista.
Geeniin PURA liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PURA voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Corners of eye widely separated
- Deep philtrum
- Depressed nasal bridge
- High palate
- Limited hair on end of eyebrow
- Little lower jaw
- Myopathic facies
- Narrow forehead
Näytä 23 piirrettä lisää
- Prominent metopic ridge
- Tented mouth
- Abnormality of baby teeth
- Abnormally small head
- Broad nasal tip
- Broad opening between the eyelids
- Decreased facial muscle tone
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Eye folds
- Facial asymmetry
- Frontal bossing
- Full cheeks
- High forehead
- Increased size of incisor
- Long face
- Nasal tip, upturned
- Prominent forehead
- Short nose
- Thin red part of the upper lip
- Underdeveloped tissue around nostril
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide nasal bridge
- Open mouth
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Global developmental delay
- Epilepsy
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- CNS hypomyelination
- Delayed CNS myelination
- Delayed myelination
Näytä 19 piirrettä lisää
- Delayed speech and language development
- EEG abnormality
- Intellectual disability, severe
- Motor delay
- Severe global developmental delay
- Anxiety
- Ataxia
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- Epileptic spasm
- Exaggerated startle response
- Focal tonic seizure
- Inability to walk
- Jerking
- Short attention span
- Speech apraxia
- Wide based walk
- Intellectual disability
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Tietojulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PURA-geeni: purine rich element binding protein A. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pura
Dante Labs. PURA-geeni: purine rich element binding protein A [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pura
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa