Geeni
PCK1
phosphoenolpyruvate carboxykinase 1
- HGNC 8724↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000124253↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5105↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 20q13.31
- Koordinaatit
- Kromosomi 20: 57 561 110–57 568 121 (GRCh38)
- Eksonit
- 10 eksonia 7 kb:n alueella
- Proteiini
- 622 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- PEPCK-C
- MANE Select -transkripti
- ENST00000319441.6NM_002591.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PCK1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnöllinen fruktoosi-intoleranssi ja glukoneogeneesin häiriöt
- Sytosolisen fosfoenolipyruvaattikarboksikinaasin puutosAutosomaalinen resessiivinen
Aiheutuu PCK1-geenin varianteista, jotka voivat aiheuttaa jaksoittaista matalaa verensokeria, usein sairastumisen tai paastoamisen aikana.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tiedon avulla voidaan välttää pitkittynyttä paastoamista ja hoitaa matala verensokeri viipymättä.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
PCK1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,3 kb geenin 7 kb:stä; 1 869 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PCK1
8
PCK1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 7 kb geenistä PCK1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,3 kb eksoneja.
Geeniin PCK1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PCK1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Laboratory abnormality
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Increased lactate in body
- Low blood sugar
- Reduced phosphoenolpyruvate carboxykinase activity in cultured fibroblasts
- Recurrent low blood sugar levels
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Elevated urine fumaric acid level
- High plasma glutamine
Näytä 11 piirrettä lisää
- High urine lactic acid levels
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Hypoglycemic seizures
- Increased urine alpha-ketoglutarate concentration
- Fatty infiltration of liver
- Low blood sugar in newborn
- High blood ammonia levels
- Decreased circulating citrulline concentration
- Impaired gluconeogenesis
- Ketonuria
- Low blood sugar when fasting
Abnormality of the nervous system
- Acute encephalopathy
- Coma caused by low blood sugar
- Drowsiness
- Lethargy
- Neurodevelopmental delay
- Degeneration of cerebrum
- EEG abnormality
- Epilepsy
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PCK1-geeni: phosphoenolpyruvate carboxykinase 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pck1
Dante Labs. PCK1-geeni: phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pck1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa