Gen
PCK1
phosphoenolpyruvate carboxykinase 1
- HGNC 8724↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000124253↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 5105↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 20q13.31
- Souřadnice
- Chromozom 20: 57 561 110–57 568 121 (GRCh38)
- Exony
- 10 exonů na 7 kb
- Protein
- 622 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- PEPCK-C
- Transkript MANE Select
- ENST00000319441.6NM_002591.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Přečtěte si PCK1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Hereditary Fructose Intolerance & Gluconeogenesis Defects
- Cytosolic Phosphoenolpyruvate Carboxykinase DeficiencyAutozomálně recesivní
Caused by variants in PCK1, which can cause episodes of low blood sugar, often during illness or fasting.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing allows avoidance of prolonged fasting and prompt treatment of low blood sugar.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je PCK1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,3 kb z 7 kb genu; 1 869 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte PCK1
8
pozic v genu PCK1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 7 kb genu PCK1, včetně intronů, nikoli jen 4,3 kb exonů.
Rysy spojené s PCK1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PCK1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Laboratory abnormality
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Increased lactate in body
- Low blood sugar
- Reduced phosphoenolpyruvate carboxykinase activity in cultured fibroblasts
- Recurrent low blood sugar levels
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Elevated urine fumaric acid level
- High plasma glutamine
Zobrazit ještě 11 rysů
- High urine lactic acid levels
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Hypoglycemic seizures
- Increased urine alpha-ketoglutarate concentration
- Fatty infiltration of liver
- Low blood sugar in newborn
- High blood ammonia levels
- Decreased circulating citrulline concentration
- Impaired gluconeogenesis
- Ketonuria
- Low blood sugar when fasting
Abnormality of the nervous system
- Acute encephalopathy
- Coma caused by low blood sugar
- Drowsiness
- Lethargy
- Neurodevelopmental delay
- Degeneration of cerebrum
- EEG abnormality
- Epilepsy
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PCK1: phosphoenolpyruvate carboxykinase 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pck1
Dante Labs. Gen PCK1: phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pck1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů