Geeni
HSPB1
heat shock protein family B (small) member 1
- HGNC 5246↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000106211↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3315↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 7q11.23
- Koordinaatit
- Kromosomi 7: 76 302 673–76 304 292 (GRCh38)
- Eksonit
- 3 eksonia 1,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 205 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- HSP27, HSP28, Hs.76067, Hsp25, CMT2F
- MANE Select -transkripti
- ENST00000248553.7NM_001540.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue HSPB1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Charcot-Marie-Tooth-tauti
Yksi 62 siihen liittyvästä geenistä
Ryhmä perinnöllisiä ääreishermostosairauksia, jotka aiheuttavat etenevää heikkoutta ja distaalisten lihasten surkastumista sekä tuntohäiriöitä, pääasiassa jaloissa ja käsissä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Geneettinen neuvonta, alatyyppikohtainen seuranta, fysioterapia, ortoosit, neurotoksisten lääkkeiden välttäminen, geenikohtaiset kliiniset tutkimukset ja siihen liittyvien piirteiden seuranta
HSPB1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 0,8 kb geenin 1,6 kb:stä; 618 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä HSPB1
32
HSPB1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 11 (34 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (11 kohtaa)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Kokogenomi kattaa kaikki 1,6 kb geenistä HSPB1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 0,8 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Yhteinen sairaus: 1
- ATP1A1ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1Yhteinen sairaus: 1
- CADM3cell adhesion molecule 3Yhteinen sairaus: 1
- COX6A1cytochrome c oxidase subunit 6A1Yhteinen sairaus: 1
- DHTKD1dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1Yhteinen sairaus: 1
- DHX9DExH-box helicase 9Yhteinen sairaus: 1
- DNM2dynamin 2Yhteinen sairaus: 1
- DRP2dystrophin related protein 2Yhteinen sairaus: 1
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Yhteinen sairaus: 1
- EGR2early growth response 2Yhteinen sairaus: 1
- FBLN5fibulin 5Yhteinen sairaus: 1
Geeniin HSPB1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita HSPB1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). HSPB1-geeni: heat shock protein family B (small) member 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hspb1
Dante Labs. HSPB1-geeni: heat shock protein family B (small) member 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hspb1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa