Geeni
HAX1
HCLS1 associated protein X-1
- HGNC 16915↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000143575↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 10456↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q21.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 154 272 629–154 275 875 (GRCh38)
- Eksonit
- 7 eksonia 3,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 279 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- HS1BP1, HCLSBP1, HAX-1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000328703.12NM_006118.4
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hax1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue HAX1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Vaikea synnynnäinen neutropenia
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
HAX1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,1 kb geenin 3,2 kb:stä; 840 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: HAX1
53
HAX1-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 3,2 kb geenistä HAX1, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 1,1 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CLPBClpB family mitochondrial disaggregaseYhteinen sairaus: 1
- CSF3Rcolony stimulating factor 3 receptorYhteinen sairaus: 1
- CXCR2C-X-C motif chemokine receptor 2Yhteinen sairaus: 1
- G6PC3glucose-6-phosphatase catalytic subunit 3Yhteinen sairaus: 1
- GFI1growth factor independent 1 transcriptional repressorYhteinen sairaus: 1
- JAGN1jagunal vesicle mediated transporter 1Yhteinen sairaus: 1
- SRP54signal recognition particle 54Yhteinen sairaus: 1
- VPS45vacuolar protein sorting 45 homologYhteinen sairaus: 1
- WASWASP actin nucleation promoting factorYhteinen sairaus: 1
Geeniin HAX1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita HAX1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). HAX1-geeni: HCLS1 associated protein X-1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hax1
Dante Labs. HAX1-geeni: HCLS1 associated protein X-1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hax1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa