Gen
HAX1
HCLS1 associated protein X-1
- HGNC 16915↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000143575↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 10456↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 1q21.3
- Coördinaten
- Chromosoom 1: 154.272.629–154.275.875 (GRCh38)
- Exons
- 7 exons over 3,2 kb
- Eiwit
- 279 aminozuren
- Ook bekend als
- HS1BP1, HCLSBP1, HAX-1
- MANE Select-transcript
- ENST00000328703.12NM_006118.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hax1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees HAX1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Ernstige congenitale neutropenie
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van HAX1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,1 kb van de 3,2 kb van het gen; 840 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van HAX1
1Laag
Hoe moeilijk HAX1 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van HAX1 in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.6,4%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.0%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
53
posities in HAX1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen ervan valt in een gebied dat korte reads lastig vinden.
Een volledig genoom dekt alle 3,2 kb van HAX1, inclusief intronen, en niet alleen de 1,1 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- CLPBClpB family mitochondrial disaggregaseDeelt 1 aandoening
- CSF3Rcolony stimulating factor 3 receptorDeelt 1 aandoening
- CXCR2C-X-C motif chemokine receptor 2Deelt 1 aandoening
- G6PC3glucose-6-phosphatase catalytic subunit 3Deelt 1 aandoening
- GFI1growth factor independent 1 transcriptional repressorDeelt 1 aandoening
- JAGN1jagunal vesicle mediated transporter 1Deelt 1 aandoening
- SRP54signal recognition particle 54Deelt 1 aandoening
- VPS45vacuolar protein sorting 45 homologDeelt 1 aandoening
- WASWASP actin nucleation promoting factorDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan HAX1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die HAX1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-17: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). HAX1-gen: HCLS1 associated protein X-1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/hax1
Dante Labs. HAX1-gen: HCLS1 associated protein X-1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/hax1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken