Geeni
COCH
cochlin
- HGNC 2180↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000100473↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 1690↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 14q12
- Koordinaatit
- Kromosomi 14: 30 874 559–30 890 618 (GRCh38)
- Eksonit
- 12 eksonia 16,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 550 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- COCH-5B2
- Aiemmat symbolit
- DFNA31, DFNA9
- MANE Select -transkripti
- ENST00000396618.9NM_004086.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue COCH ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Kuulonalenema ja kuurous
- Autosomaalisesti dominantti, ei-oireyhtymään kuuluva kuulonalenemaAutosomaalinen dominantti
Ei-oireyhtymään kuuluvan kuurouden autosomaalisesti dominantti muoto.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Oireeton geneettinen kuulonalenema
Yksi 97 siihen liittyvästä geenistä
Perinnöllinen kuulonalenema ilman muita lääketieteellisiä oireita. Siihen kuuluvat yleiset resessiiviset muodot, joita aiheuttavat GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC ja monet muut geenit, sekä dominantit, X-kromosomiin liittyvät ja mitokondriaaliset muodot.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Geneettisen syyn tunteminen voi ohjata kuulotukea ja sisäkorvaistutteen valintaa, auttaa arvioimaan osallistumismahdollisuutta geenihoitokokeisiin (esimerkiksi OTOF) ja tukea perheneuvontaa.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
COCH-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,5 kb geenin 16,1 kb:stä; 1 653 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä COCH
22
COCH-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 16,1 kb geenistä COCH, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,5 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (6)
Tässä ovat COCH-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| G87A | c.260G>C | Eksoni 5 | 30 878 831 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| G87E | c.260G>A | Eksoni 5 | 30 878 831 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| G87V | c.260G>T | Eksoni 5 | 30 878 831 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| G87W | c.259G>T | Eksoni 5 | 30 878 830 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| G88E | c.263G>A | Eksoni 5 | 30 878 834 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| P51S | c.151C>T | Eksoni 4 | 30 877 640 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ACTG1actin gamma 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AYhteisiä sairauksia: 2
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Yhteisiä sairauksia: 2
- CD164CD164 moleculeYhteisiä sairauksia: 2
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentYhteisiä sairauksia: 2
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainYhteisiä sairauksia: 2
- COL11A2collagen type XI alpha 2 chainYhteisiä sairauksia: 2
- DIAPH1diaphanous related formin 1Yhteisiä sairauksia: 2
- EYA4EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4Yhteisiä sairauksia: 2
- GJB2gap junction protein beta 2Yhteisiä sairauksia: 2
- GJB6gap junction protein beta 6Yhteisiä sairauksia: 2
- GREB1LGREB1 like retinoic acid receptor coactivatorYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin COCH liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita COCH voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). COCH-geeni: cochlin. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/coch
Dante Labs. COCH-geeni: cochlin [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/coch
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa