Geen
RAG2
recombination activating 2
- HGNC 9832↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000175097↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 5897↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11p12
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 36 591 943–36 598 236 (GRCh38)
- Eksonid
- 2 eksonit, ulatus 6,3 kb
- Valk
- 527 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- MANE Select transkript
- ENST00000311485.8NM_000536.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe RAG2 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Raske kombineeritud immuunpuudulikkus
- Autosoomne retsessiivne
Raske kombineeritud immuunpuudulikkus (SCID) on haruldaste monogeensete primaarsete immuunpuudulikkuste rühm, mida iseloomustab funktsionaalsete perifeersete T-lümfotsüütide puudumine. See põhjustab varajases eas raskeid hingamisteede infektsioone ja kasvuhäireid. Immunoloogilise fenotüübi järgi jaotatakse need SCID-ks, mille puhul T-rakud puuduvad, kuid B-rakud esinevad (T-B+ SCID), ja SCID-ks, mille puhul puuduvad nii T- kui ka B-rakud (T-B- SCID). Mõlemasse rühma kuulub mitu vormi, millega kaasneb või mis ei kaasne loomulike tapjarakkude (NK-rakud) puudumist.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Ostali pärilikud immuunpuudulikkused
- Immuunpuudulikkushaigus
Üks 170 sellega seotud geenist
Haigus, mille korral on rakulise või humoraalse immuunsuse mehhanismid puudulikud või defektsed.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
HSCT raske kombineeritud immuunpuudulikkuse (SCID) ja muude raskete PID-ide korral; immunoglobuliini asendusravi (IVIG/SCIG) antikehade puudulikkuse korral; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-i korral; geenravi ADA-SCID-i korral; abatatsept CTLA4/LRBA puudulikkuse korral; profülaktilised antibiootikumid; G-CSF CGD korral
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas RAG2 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,4 kb kogupikkusega 6,3 kb; neist 1584 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse RAG2
112
kohad geenis RAG2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni RAG2 6,3 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,4 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ADAadenosine deaminaseJagab 2 haigust
- AK2adenylate kinase 2Jagab 2 haigust
- BCL11BBCL11 transcription factor BJagab 2 haigust
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Jagab 2 haigust
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Jagab 2 haigust
- CD247CD247 moleculeJagab 2 haigust
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexJagab 2 haigust
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexJagab 2 haigust
- CD70CD70 moleculeJagab 2 haigust
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorJagab 2 haigust
- CORO1Acoronin 1AJagab 2 haigust
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CJagab 2 haigust
Geeniga RAG2 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida RAG2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the immune system
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
- Meningitis
Näita veel 16 tunnust
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Recurrent enteroviral infections
- Recurrent fungal infections
- Autoimmunity
- Combined immunodeficiency
- Recurrent opportunistic infections
- Recurrent respiratory infections
- Severe T-cell immunodeficiency
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
Näita veel 14 tunnust
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Abnormal total B cell count
- Abnormal total T cell number
- Decreased blood lymphocyte number
- High lymphocyte count
- Low T cell count
- Abnormal total natural killer cell count
- Autoimmune hemolytic anemia
- Cancer of lymphatic system
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
- Spongiosis
Näita veel 4 tunnust
Abnormal cellular phenotype
- Agammaglobulinemia
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Impaired phytohemagglutinin-induced T lymphocyte transformation
- Increased circulating IgE concentration
- Decreased circulating antibody level
- Decreased circulating IgM concentration
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Generalized swelling of lymph nodes
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Swollen lymph nodes
- Enlarged liver and spleen
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Mastoiditis
- Pink eye
Näita veel 1 tunnus
Laboratory abnormality
- Bacteremia
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- Episodic fever
- Fluid retention
- Low albumin
- Persistent fever
- Fever
- High liver enzymes
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RAG2 geen: recombination activating 2. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rag2
Dante Labs. RAG2 geen: recombination activating 2 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rag2
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast