Genas
RAG2
recombination activating 2
- HGNC 9832↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000175097↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 5897↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 11p12
- Koordinatės
- Chromosoma 11: 36 591 943–36 598 236 (GRCh38)
- Eksonai
- 2 eksonų per 6,3 kb
- Baltymas
- 527 aminorūgščių
- MANE Select transkriptas
- ENST00000311485.8NM_000536.4
- Lokuso tipas
- Protein-coding
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rag2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite RAG2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Teži kombinuotas imunodeficitas
- Autosominis recesyvinis
Teži kombinuotas imunodeficitas (SCID) – tai retų monogeninių pirminių imunodeficitų grupė, kuriai būdingas funkcinių periferinių T limfocitų trūkumas, sukeliantis ankstyvas sunkias kvėpavimo takų infekcijas ir nepakankamą vaikų augimą bei vystymąsi. Pagal imunologinį fenotipą jie skirstomi į SCID, kai nėra T ląstelių, bet yra B ląstelių (T-B+ SCID), ir SCID, kai nėra abiejų (T-B- SCID). Abi šios grupės apima kelias formas, su natūraliųjų žudikų (NK) ląstelėmis arba be jų.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Platesnės grupės
Kiti įgimti imunodeficitai
- Imunodeficito liga
Vienas iš 170 su juo susijusių genų
Liga, kai sutrikusi arba nepakankamai išsivysčiusi imuninė apsauga – tiek ląstelinė, tiek humoralinė.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
HSCT (hematopoetinių kamieninių ląstelių transplantacija) taikoma SCID ir sunkioms pirminėms imunodeficito ligoms gydyti; imunoglobulinų papildymas (IVIG/SCIG) – antikūnų nepakankamumui; leniolisibas (Joenja, FDA 2023) – APDS; genų terapija – ADA-SCID; abatacepto – CTLA4 ir LRBA nepakankamumui; profilaktiniai antibiotikai; G-CSF – CGD
Kaip išdėstytas RAG2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 2,4 kb iš 6,3 kb geno; 1 584 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: RAG2
112
vietos geno RAG2 sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurioje trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 6,3 kb geno RAG2, įskaitant intronus, o ne tik 2,4 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ADAadenosine deaminaseTuri 2 bendrų būklių
- AK2adenylate kinase 2Turi 2 bendrų būklių
- BCL11BBCL11 transcription factor BTuri 2 bendrų būklių
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Turi 2 bendrų būklių
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Turi 2 bendrų būklių
- CD247CD247 moleculeTuri 2 bendrų būklių
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexTuri 2 bendrų būklių
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexTuri 2 bendrų būklių
- CD70CD70 moleculeTuri 2 bendrų būklių
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorTuri 2 bendrų būklių
- CORO1Acoronin 1ATuri 2 bendrų būklių
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CTuri 2 bendrų būklių
Savybės, susijusios su RAG2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti RAG2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the immune system
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
- Meningitis
Rodyti dar 16 savybių
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Recurrent enteroviral infections
- Recurrent fungal infections
- Autoimmunity
- Combined immunodeficiency
- Recurrent opportunistic infections
- Recurrent respiratory infections
- Severe T-cell immunodeficiency
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
Rodyti dar 14 savybių
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Abnormal total B cell count
- Abnormal total T cell number
- Decreased blood lymphocyte number
- High lymphocyte count
- Low T cell count
- Abnormal total natural killer cell count
- Autoimmune hemolytic anemia
- Cancer of lymphatic system
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
- Spongiosis
Rodyti dar 4 savybių
Abnormal cellular phenotype
- Agammaglobulinemia
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Impaired phytohemagglutinin-induced T lymphocyte transformation
- Increased circulating IgE concentration
- Decreased circulating antibody level
- Decreased circulating IgM concentration
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Generalized swelling of lymph nodes
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Swollen lymph nodes
- Enlarged liver and spleen
Rodyti dar 3 savybių
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Mastoiditis
- Pink eye
Rodyti dar 1 savybę
Laboratory abnormality
- Bacteremia
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- Episodic fever
- Fluid retention
- Low albumin
- Persistent fever
- Fever
- High liver enzymes
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). RAG2 genas: recombination activating 2. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/rag2
Dante Labs. RAG2 genas: recombination activating 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/rag2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites