Geen
PDE6A
phosphodiesterase 6A
- HGNC 8785↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000132915↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 5145↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 5q32
- Koordinaadid
- Kromosoom 5: 149 857 953–149 944 793 (GRCh38)
- Eksonid
- 22 eksonit, ulatus 86,8 kb
- Valk
- 860 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- RP43
- Varasemad tähised
- PDEA
- MANE Select transkript
- ENST00000255266.10NM_000440.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PDE6A ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Retinitis pigmentosa
- PDE6A-seotud retinopaatiaAutosoomne retsessiivne
Võrkkesta düstroofia, mis on põhjustatud PDE6A geeni muutustest.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Üks 77 sellega seotud geenist
Pärilike võrkkesta düstroofiate rühm, mille puhul toimub varraste ja seejärel kolbide fotoretseptorite progresseeruv kadu, põhjustades öise pimeduse ja järkjärgulise perifeerse nägemise kaotuse.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas PDE6A on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 5,6 kb kogupikkusega 86,8 kb; neist 2583 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PDE6A
61
kohad geenis PDE6A, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PDE6A 86,8 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (5,6 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Jagab 1 haigust
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Jagab 1 haigust
- AHRaryl hydrocarbon receptorJagab 1 haigust
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Jagab 1 haigust
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinJagab 1 haigust
- ARL3ARF like GTPase 3Jagab 1 haigust
- ARL6ARF like GTPase 6Jagab 1 haigust
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Jagab 1 haigust
- BEST1bestrophin 1Jagab 1 haigust
- CA4carbonic anhydrase 4Jagab 1 haigust
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AJagab 1 haigust
- CDHR1cadherin related family member 1Jagab 1 haigust
Geeniga PDE6A seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PDE6A võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the eye
- Difficulties with night vision
- Loss of peripheral vision
- Optic disc pallor
- Pigmentary retinopathy
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
Näita veel 20 tunnust
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Optic disc drusen
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Decreased clarity of vision
- Photopsia
- Rod-cone dystrophy
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PDE6A geen: phosphodiesterase 6A. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pde6a
Dante Labs. PDE6A geen: phosphodiesterase 6A [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pde6a
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast