Geen
CFAP53
cilia and flagella associated protein 53
- HGNC 26530↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000172361↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 220136↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 18q21.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 18: 50 227 193–50 266 495 (GRCh38)
- Eksonid
- 8 eksonit, ulatus 39,3 kb
- Valk
- 514 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FLJ32743
- Varasemad tähised
- CCDC11
- MANE Select transkript
- ENST00000398545.5NM_145020.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Loe CFAP53 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Heterotaksia ja lateraalsuse defektid
- Viskeraalne heterotaksia
Siseorganite ebanormaalne vasak-parem paigutus, mis on põhjustatud selliste geenide muutustest nagu ZIC3 (X-seotud), NODAL, CFC1, MMP21 ja PKD1L1, sageli koos keeruliste südamedefektide ja põrna kõrvalekalletega.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Sellest teadmine aitab planeerida süda- ja kõhuõõne uuringuid, võtta infektsioonide ennetusmeetmeid juhul, kui põrn puudub, ning pakub nõustamist reproduktiivküsimustes.
Kuidas CFAP53 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,8 kb kogupikkusega 39,3 kb; neist 1545 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CFAP53
9
kohad geenis CFAP53, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CFAP53 39,3 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,8 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ACVR2Bactivin A receptor type 2BJagab 1 haigust
- CFC1cryptic, EGF-CFC family member 1Jagab 1 haigust
- CIROPciliated left-right organizer metallopeptidaseJagab 1 haigust
- DAW1dynein assembly factor with WD repeats 1Jagab 1 haigust
- GDF1growth differentiation factor 1Jagab 1 haigust
- MMP21matrix metallopeptidase 21Jagab 1 haigust
- MNS1meiosis specific nuclear structural 1Jagab 1 haigust
- NODALnodal growth differentiation factorJagab 1 haigust
- PKD1L1polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interactingJagab 1 haigust
- ZIC3Zic family zinc finger 3Jagab 1 haigust
Geeniga CFAP53 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CFAP53 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the cardiovascular system
- All organs on wrong side of body
- Common atrium
- Double outlet right ventricle
- Heart tip and four chambers point towards right side of body
- Right aortic arch
- Total anomalous pulmonary venous return
- Transposition of the great arteries
- Unbalanced atrioventricular canal defect
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CFAP53 geen: cilia and flagella associated protein 53. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cfap53
Dante Labs. CFAP53 geen: cilia and flagella associated protein 53 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cfap53
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast