Γονίδιο
TDP1
tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1
- HGNC 18884↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000042088↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 55775↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 14q32.11
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 14: 89.955.927–90.044.764 (GRCh38)
- Εξόνια
- 17 έξώνια σε 88,8 kb
- Πρωτεΐνη
- 608 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- FLJ11090, SCAN1
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000335725.9NM_018319.4
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tdp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το TDP1, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Νόσος Επιδιόρθωσης του DNA
- Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
Νόσος που έχει ως βάση τη διαταραχή της επιδιόρθωσης του DNA.
- 1 υποβολέας του GenCC την αξιολογεί ως οριστική ή ισχυρή
Ευρύτερες ομάδες
Αυτοσωμικές υπολειπόμενες cerebellar αταξίες (συμπεριλαμβανομένων των CANVAS και AVED)
- Αυτοσωμική υπολειπόμενη cerebellar αταξίαΑυτοσωμικός υπολειπόμενος
Ένα από τα 57 γονίδια που συνδέονται με αυτό
Μια ομάδα υπολειπόμενα κληρονομούμενων αταξιών που προκαλούνται από διαλληλικές μεταβολές σε γονίδια όπως τα RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 και SYNE1.
- 1 υποβολέας του GenCC την αξιολογεί ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Η αταξία με ανεπάρκεια βιταμίνης Ε (TTPA) αντιμετωπίζεται με συμπληρώματα βιταμίνης Ε· οι άλλες μορφές διαχειρίζονται με φυσιοθεραπεία και φροντίδα των συμπτωμάτων, και στους συγγενείς μπορεί να προσφερθεί έλεγχος φορέα.
Πώς είναι διαταγμένο το TDP1
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 3,7 kb από τα 88,8 kb του γονιδίου· 1.827 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχιση του TDP1
3
θέσεις στο TDP1 όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα δυσκολεύονται να εντοπίσουν.
Μια ολόκληρη αλληλούχιση γονιδιώματος καλύπτει και τα 88,8 kb του TDP1, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 3,7 kb των εξονίων.
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Μοιράζεται 2 παθήσεις
- SETXsenataxinΜοιράζεται 2 παθήσεις
- AHI1Abelson helper integration site 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- ANO10anoctamin 10Μοιράζεται 1 πάθηση
- APTXaprataxinΜοιράζεται 1 πάθηση
- ATCAYATCAY kinesin light chain interacting caytaxinΜοιράζεται 1 πάθηση
- ATG7autophagy related 7Μοιράζεται 1 πάθηση
- ATP8A2ATPase phospholipid transporting 8A2Μοιράζεται 1 πάθηση
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedΜοιράζεται 1 πάθηση
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedΜοιράζεται 1 πάθηση
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- CA8carbonic anhydrase 8 (inactive)Μοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το TDP1
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το TDP1. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the nervous system
- Absent reflexes
- Ataxia
- Decreased number of peripheral myelinated nerve fibers
- Decreased sensation in extremities
- Degeneration of cerebellum
- Difficulty articulating speech
- High stepping
- Impaired distal proprioception
Εμφάνιση 14 ακόμη χαρακτηριστικών
- Impaired vibratory sensation
- Cerebellar vermis atrophy
- Decreased motor nerve conduction velocity
- Degeneration of cerebrum
- Epilepsy
- Generalized brain degeneration
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Pain insensitivity
- Peripheral neuropathy
- Spinocerebellar tract degeneration
- Damage to nerves that sense feeling
- Intellectual disability
- Peripheral axonal neuropathy
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-17: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.17-8666dff2.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο TDP1: tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1. Ανάκτηση 18 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/tdp1
Dante Labs. Γονίδιο TDP1: tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 [Internet]. [ανακτήθηκε 18 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/tdp1
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες