Gen
NHLRC1
NHL repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1
- HGNC 21576↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000187566↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 378884↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 6p22.3
- Souřadnice
- Chromozom 6: 18 120 440–18 122 677 (GRCh38)
- Exony
- 1 exon na 2,2 kb
- Protein
- 395 aminokyselin
- Další názvy
- bA204B7.2, EPM2B
- Transkript MANE Select
- ENST00000340650.6NM_198586.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si NHLRC1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
Jeden z 171 genů spojených s touto vazbou
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je NHLRC1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 2,2 kb z 2,2 kb genu; 1 188 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte NHLRC1
36
pozic v genu NHLRC1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 2,2 kb genu NHLRC1, včetně intronů, nikoli jen 2,2 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseSdílí 1 onemocnění
- ACTL6Bactin like 6BSdílí 1 onemocnění
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Sdílí 1 onemocnění
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Sdílí 1 onemocnění
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorSdílí 1 onemocnění
- ARXaristaless related homeoboxSdílí 1 onemocnění
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Sdílí 1 onemocnění
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s NHLRC1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit NHLRC1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Jerking
- Lafora bodies
- Epilepsy
- Grand mal seizures
- Myoclonic seizure
- Worsening neurological symptoms
- Abnormal gait
- Ataxia
Zobrazit ještě 25 rysů
- Can't control feelings
- Confusion
- Dementia
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Erratic myoclonus
- Generalized myoclonic seizure
- Giant somatosensory evoked potentials
- Headache
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Mental deterioration
- Repeated seizures without recovery between them
- Visual hallucinations
- Atypical absence seizure
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Brain degeneration
- Brief seizures with staring spells
- Difficulty sleeping
- Focal impaired awareness seizure
- Focal sensory seizure with visual features
- Seizure affecting one half of brain
- Sudden loss of muscle tone
- Typical absence seizure
- Vegetative state
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen NHLRC1: NHL repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/nhlrc1
Dante Labs. Gen NHLRC1: NHL repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/nhlrc1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů