AtlasGen
FBXO22
F-box protein 22
- HGNC 13593↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000167196↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 26263↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 15q24.2
- Koordinater
- Kromosom 15: 75 903 878–75 942 511 (GRCh38)
- Exoner
- 7 exoner på 38,6 kb
- Protein
- 403 aminosyror
- Även känd som
- FBX22, FISTC1
- MANE Select-transkript
- ENST00000308275.8NM_147188.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
AtlasDen här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fbxo22.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs FBXO22, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser FBXO22 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är FBXO22 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 10,7 kb av genens 38,6 kb, och 1 212 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av FBXO22
5Lätt
Hur svår FBXO22 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i FBXO22 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av FBXO22:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 100 %.2 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vikt 60 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 50 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 30 %.4,8 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 20 %.9,7 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av FBXO22:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Egenskaper kopplade till FBXO22
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som FBXO22 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal kidney location
- Absent kidney
- Bilateral renal dysplasia
- Cystic kidney disease
- Hyperechogenic kidneys
- Short penis
- Small kidneys
- Undescended testes
Visa ytterligare 3 egenskaper
Abnormality of the cardiovascular system
- Biventricular hypertrophy
- Narrowing of aorta
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Patent ductus arteriosus
- Patent foramen ovale
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Hypoplastic tricuspid valve
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). FBXO22-genen: F-box protein 22. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/fbxo22
Dante Labs. FBXO22-genen: F-box protein 22 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/fbxo22
AtlasEtt test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor