Gene
TNFRSF9
TNF receptor superfamily member 9
- HGNC 11924↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000049249↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 3604↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 1p36.23
- Coordenadas
- Cromossoma 1: 7 915 871–7 940 839 (GRCh38)
- Exões
- 8 exões ao longo de 25 kb
- Proteína
- 255 aminoácidos
- Também conhecido como
- CD137, 4-1BB
- Símbolos anteriores
- ILA
- Transcrito MANE Select
- ENST00000377507.8NM_001561.6
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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page$gene$nameAnalise TNFRSF9, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Outros Erros Inatos da Imunidade
- Doença de Imunodeficiência
Um de 170 genes ligados a este
Doença em que existe uma deficiência ou defeito nos mecanismos da imunidade, quer celular quer humoral.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 3 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
Transplante de células-tronco hematopoiéticas (HSCT) para SCID e PID graves; substituição de imunoglobulinas (IVIG/SCIG) para deficiências de anticorpos; leniolisib (Joenja, FDA 2023) para APDS; terapia génica para SCID-ADA; abatacept para deficiência de CTLA4/LRBA; antibióticos profiláticos; G-CSF para CGD
Como TNFRSF9 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 5,9 kb dos 25 kb do gene; 768 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de TNFRSF9
3Fácil
Dificuldade de sequenciação de TNFRSF9 com leituras curtas, em 100
0 · Fácil100 · Difícil
Quase todos os exões de TNFRSF9 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.
O que acresce: a proporção dos exões de TNFRSF9 em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Peso 100%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com identidade de 90% ou mais. Peso 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Peso 60%.0%
- Cobertura da referênciaLacunas nas proximidades na montagem de referência, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Peso 50%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não as abranger. Peso 30%.6,2%
- Conteúdo GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma insuficiente. Peso 20%.4,5%
Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de TNFRSF9 nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhum, 100 quando todas as bases estão em regiões onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
Genes associados às mesmas condições
- ADAadenosine deaminasePartilha 1 condição
- AICDAactivation induced cytidine deaminasePartilha 1 condição
- AK2adenylate kinase 2Partilha 1 condição
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BPartilha 1 condição
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Partilha 1 condição
- ATMATM serine/threonine kinasePartilha 1 condição
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Partilha 1 condição
- B2Mbeta-2-microglobulinPartilha 1 condição
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Partilha 1 condição
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorPartilha 1 condição
- BCL11BBCL11 transcription factor BPartilha 1 condição
- BLNKB cell linkerPartilha 1 condição
Características associadas a TNFRSF9
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que TNFRSF9 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicados em 2026-10-19: as condições a que o gene está associado e a força dessa associação.
- A lista de achados secundários do ACMG, SF v3.2.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.19-9814e911.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene TNFRSF9: TNF receptor superfamily member 9. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/tnfrsf9
Dante Labs. Gene TNFRSF9: TNF receptor superfamily member 9 [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/tnfrsf9
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