Gen
TNFRSF9
TNF receptor superfamily member 9
- HGNC 11924↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000049249↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 3604↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 1p36.23
- Coordenadas
- Cromosoma 1: 7.915.871–7.940.839 (GRCh38)
- Exones
- 8 exones en 25 kb
- Proteína
- 255 aminoácidos
- También conocido como
- CD137, 4-1BB
- Símbolos anteriores
- ILA
- Transcrito MANE Select
- ENST00000377507.8NM_001561.6
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Otros errores innatos de la inmunidad
- Enfermedad por inmunodeficiencia
Uno de 170 genes relacionados con ello
Enfermedad en la que existe una deficiencia o un defecto en los mecanismos inmunitarios, ya sean celulares o humorales.
- ClinGen clasifica la asociación como definitiva
- 3 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
▶Accionabilidad
TCMH para la IDCG y las IDP graves; terapia sustitutiva con inmunoglobulinas (IVIG/SCIG) para las deficiencias de anticuerpos; leniolisib (Joenja, FDA 2023) para el APDS; terapia génica para la IDCG por deficiencia de ADA; abatacept para la deficiencia de CTLA4/LRBA; profilaxis antibiótica; G-CSF para la EGC
Estructura de TNFRSF9
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 5,9 kb de los 25 kb del gen; 768 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de TNFRSF9
3Fácil
Lo difícil que es secuenciar TNFRSF9 con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Casi todos los exones de TNFRSF9 se encuentran en zonas donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.
Lo que suma: la proporción de los exones de TNFRSF9 en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos en los que las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Peso 100 %.0 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con una identidad del 90 % o más. Peso 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Peso 60 %.0 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia con la que las lecturas puedan alinearse. Peso 50 %.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y que puede que no abarquen. Peso 30 %.6,2 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma deficiente. Peso 20 %.4,5 %
Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle, del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de los exones de TNFRSF9 que se encuentran en ese tipo de región difícil. Cualquier tipo por sí solo puede hacer difícil un gen, y cada tipo adicional suma menos: 0 cuando ninguna base está en ninguno, 100 cuando todas las bases están donde las lecturas no pueden ubicarse de forma única.
Genes vinculados a las mismas afecciones
- ADAadenosine deaminaseComparte 1 afección
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseComparte 1 afección
- AK2adenylate kinase 2Comparte 1 afección
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BComparte 1 afección
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Comparte 1 afección
- ATMATM serine/threonine kinaseComparte 1 afección
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Comparte 1 afección
- B2Mbeta-2-microglobulinComparte 1 afección
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Comparte 1 afección
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorComparte 1 afección
- BCL11BBCL11 transcription factor BComparte 1 afección
- BLNKB cell linkerComparte 1 afección
Rasgos asociados a TNFRSF9
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que TNFRSF9 puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-19: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista de hallazgos secundarios del ACMG, SF v3.2.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de los datos 2026.10.19-9814e911.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen TNFRSF9: TNF receptor superfamily member 9. Consultado el 19 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/tnfrsf9
Dante Labs. Gen TNFRSF9: TNF receptor superfamily member 9 [Internet]. [citado 19 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/tnfrsf9
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