Gen
MYO1E
myosin IE
- HGNC 7599↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000157483↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 4643↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 15q22.2
- Współrzędne
- Chromosom 15: 59 132 434–59 372 871 (GRCh38)
- Eksony
- 28 eksonów na odcinku 240,4 kb
- Białko
- 1108 aminokwasów
- Znany również jako
- MYO1C, HuncM-IC, MGC104638
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000288235.9NM_004998.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/myo1e.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj MYO1E oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Ogniskowo-segmentalne stwardnienie kłębuszków nerkowych
Schorzenie nerek charakteryzujące się zmianami stwardnieniowymi w kłębuszkach nerkowych. Przyczyny obejmują leki, wirusy i nowotwory złośliwe (chłoniaki), lub może ono mieć podłoże idiopatyczne. Objawia się bezobjawowym białkomoczem lub zespołem nerczycowym, a może prowadzić do niewydolności nerek.
- 3 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Stwardnienie kłębuszków nerkowych
Stwardnienie kłębuszka nerkowego spowodowane bliznowaceniem naczyń krwionośnych.
- 3 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu MYO1E
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 8,6 kb z 240,4 kb genu; 3327 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie MYO1E
1Niski
Jak trudno sekwencjonować MYO1E krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych MYO1E w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.1,3%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.4,3%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
15
pozycje w MYO1E, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 240,4 kb MYO1E, łącznie z intronami, a nie tylko 8,6 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ACTN4actinin alpha 4Wspólnych schorzeń: 2
- ANLNanillin, actin binding proteinWspólnych schorzeń: 2
- CRB2crumbs cell polarity complex component 2Wspólnych schorzeń: 2
- FAT1FAT atypical cadherin 1Wspólnych schorzeń: 2
- INF2inverted formin 2Wspólnych schorzeń: 2
- PAX2paired box 2Wspólnych schorzeń: 2
- TRPC6transient receptor potential cation channel subfamily C member 6Wspólnych schorzeń: 2
Cechy powiązane z genem MYO1E
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać MYO1E. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen MYO1E: myosin IE. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/myo1e
Dante Labs. Gen MYO1E: myosin IE [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/myo1e
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni