Genas
TRA2B
transformer 2 beta homolog
- HGNC 10781↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000136527↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6434↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 3q27.2
- Koordinatės
- Chromosoma 3: 185 914 558–185 938 014 (GRCh38)
- Eksonai
- 9 eksonų per 23,5 kb
- Baltymas
- 288 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- Htra2-beta, PPP1R156
- Ankstesni simboliai
- SFRS10
- MANE Select transkriptas
- ENST00000453386.7NM_004593.3
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tra2b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite TRA2B ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Sindromas kompleksinis neurovystymosi sutrikimas
Sutrikimų grupė, kuriems būdingas vystymosi vėlavimas ir požymiai, išeinantys už smegenų ribų; kiekvieną jų sukelia pokyčiai viename gene. Kai kurie čia nurodyti genai, pavyzdžiui ANKRD17, ASH1L ir MYT1L, sukelia ligą, kai pakinta viena kopija, paprastai de novo; su AFG2A susijusią ligą sukelia pokyčiai abiejose kopijose.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Vystymosi, mokymosi ir terapijos palaikymas, taip pat tyrimai dėl traukulių, augimo, regos, klausos ir kitų organų požymių, rekomenduojamų pagal konkretų geną. Genetinis konsultavimas priklauso nuo geno: de novo dominuojančių pokyčių atveju tiriami tėvai, o recesyvinių formų atveju tikrinamas nešiotojo statusas.
Kaip išdėstytas TRA2B
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,2 kb iš 23,5 kb geno; 867 šių bazių koduoja baltymą.
TRA2B sekvenavimas
1Lengva
Kiek sunku sekvenuoti geną TRA2B trumpaisiais skaitiniais, iš 100
0 · Lengva100 · Sunku
Beveik visi geno TRA2B eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai aiškiai susiejami su genomu.
Kas prie to prisideda: geno TRA2B eksonų dalis kiekvienos rūšies sunkiose srityse
- AtvaizduojamumasRuožai, kuriuose 100 ar 250 bp skaitinių negalima vienareikšmiškai išdėstyti, todėl ten užfiksuotas variantas gali būti praleistas arba klaidingas. Svoris 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kitose genomo vietose esančios kopijos, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kurių tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido ilgos sekos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti jų visų. Svoris 15 %.1,7 %
- GC kiekisLangai, kuriuose G ir C yra mažiau nei 25 % arba daugiau nei 65 %; bibliotekos paruošimas juos apima silpnai. Svoris 10 %.3,3 %
- Nuorodinio genomo padengimasNetoliese esantys nuorodinio genomo surinkimo tarpai, kur nėra sekos, prie kurios skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris 10 %.0 %
„Dante Labs“ įvertinimas, sukurtas mūsų tyrimų pagrindu, remiantis NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojamaKiekviena juosta rodo geno TRA2B eksonų bazių dalį tokio tipo sunkiose srityse. Bet kuri viena rūšis gali pati savaime padaryti geną sunkiai sekvenuojamą, o kiekviena papildoma rūšis prideda vis mažiau: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokią, 100, kai visos bazės yra vietose, kur skaitiniai negali būti vienareikšmiškai išdėstyti.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- AFG2AAAA ATPase AFG2ATuri 1 bendrą būklę
- ANKRD17ankyrin repeat domain 17Turi 1 bendrą būklę
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Turi 1 bendrą būklę
- ASH1LASH1 like histone lysine methyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- BRPF1bromodomain and PHD finger containing 1Turi 1 bendrą būklę
- MYT1Lmyelin transcription factor 1 likeTuri 1 bendrą būklę
- NFIBnuclear factor I BTuri 1 bendrą būklę
- PAN2poly(A) specific ribonuclease subunit PAN2Turi 1 bendrą būklę
- QRICH1glutamine rich 1Turi 1 bendrą būklę
- RNU4-2RNA, U4 small nuclear 2Turi 1 bendrą būklę
- SETD5SET domain containing 5Turi 1 bendrą būklę
- TBCKTBC1 domain containing kinaseTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su TRA2B
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti TRA2B, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Difficulty staying asleep
- Inability to coordinate movements when walking
- Intellectual disability
- Moderate global developmental delay
- Profound global developmental delay
- Severe global developmental delay
Rodyti dar 15 savybių
- Difficulty sleeping
- Generalized brain degeneration
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Interictal EEG abnormality
- Thin corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Aggressive behavior
- Autism spectrum disorder
- Cortical dysplasia
- Delayed CNS myelination
- Epileptic encephalopathy
- Low frustration tolerance
- Repetitive movements
- Small cerebellum
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-18: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-8b139e39.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). TRA2B genas: transformer 2 beta homolog. Pasiekta 2026 m. spalio 19 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/tra2b
Dante Labs. TRA2B genas: transformer 2 beta homolog [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 19 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/tra2b
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites