Genas
TDP2
tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2
- HGNC 17768↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000111802↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 51567↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 6p22.3
- Koordinatės
- Chromosoma 6: 24 649 979–24 666 899 (GRCh38)
- Eksonai
- 7 eksonų per 16,9 kb
- Baltymas
- 362 aminorūgščių
- Ankstesni simboliai
- TTRAP
- MANE Select transkriptas
- ENST00000378198.9NM_016614.3
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tdp2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite TDP2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Autosominės recesyvinės smegenėlių ataksijos (įsk. CANVAS ir AVED)
- Autosominė recesyvinė smegenėlių ataksijaAutosominis recesyvinis
Vienas iš 57 su juo susijusių genų
Recesyviai paveldimų ataksijų grupė, kurią sukelia biallelinės variantų geno RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 ir SYNE1 atvejais.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Ataksiją dėl vitamino E trūkumo (TTPA) galima gydyti vitamino E preparatais; kitos formos valdomos fizioterapija ir simptomų priežiūra, o giminaičiams gali būti siūlomas nešiotojo tyrimas.
Epilepsija (pilnas tyrimas)
- Epilepsija
Susijusi su 171 genu
Smegenų sutrikimas, pasireiškiantis epizodais, kai neuronai nenormaliai intensyviai išsikrauna, dėl ko atsiranda trumpalaikiai jutimo ar judesio neurologinio funkcijos sutrikimo arba psichikos funkcijos sutrikimo epizodai. Šie epizodai gali būti susiję arba nesusiję su sąmonės netekimu ar traukuliais.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas TDP2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 1,9 kb iš 16,9 kb geno; 1 089 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: TDP2
5
vietos geno TDP2 sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurioje trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 16,9 kb geno TDP2, įskaitant intronus, o ne tik 1,9 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- PNKPpolynucleotide kinase 3'-phosphataseTuri 2 bendrų būklių
- RUBCNrubicon autophagy regulatorTuri 2 bendrų būklių
- WWOXWW domain containing oxidoreductaseTuri 2 bendrų būklių
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Turi 1 bendrą būklę
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ACTL6Bactin like 6BTuri 1 bendrą būklę
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Turi 1 bendrą būklę
- AHI1Abelson helper integration site 1Turi 1 bendrą būklę
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Turi 1 bendrą būklę
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitTuri 1 bendrą būklę
- ANO10anoctamin 10Turi 1 bendrą būklę
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su TDP2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti TDP2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). TDP2 genas: tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/tdp2
Dante Labs. TDP2 genas: tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/tdp2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites