Genas
KCNJ8
potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 8
- HGNC 6269↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000121361↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 3764↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 12p12.1
- Koordinatės
- Chromosoma 12: 21 764 955–21 774 706 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 9,8 kb
- Baltymas
- 424 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- Kir6.1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000240662.3NM_004982.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnj8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite KCNJ8 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Kantú sindromas
- Autosominis dominantinis
Jį sukelia funkcijos padidėjimo pokyčiai vienoje ABCC9 arba KCNJ8 geno kopijoje. Šie genai kartu sudaro kalio kanalą (KATP kanalą) raumenų ir kraujagyslių ląstelėse. Kiekvienas paveikto asmens vaikas turi 50 % tikimybę paveldėti šį pokytį.
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Reguliarūs širdies ir kraujagyslių tyrimai, esant poreikiui – atviros arterinės (botalo) latakės uždarymas ir dėmesys skysčiui aplink širdį. Genetinė konsultacija ir tėvų tyrimas padeda įvertinti pasikartojimo riziką.
Kaip išdėstytas KCNJ8
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 2,3 kb iš 9,8 kb geno; 1 275 šių bazių koduoja baltymą.
KCNJ8 sekvenavimas
5Lengva
Kiek sunku sekvenuoti geną KCNJ8 trumpaisiais skaitiniais, iš 100
0 · Lengva100 · Sunku
Beveik visi geno KCNJ8 eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai aiškiai susiejami su genomu.
Kas prie to prisideda: geno KCNJ8 eksonų dalis kiekvienos rūšies sunkiose srityse
- AtvaizduojamumasRuožai, kuriuose 100 ar 250 bp skaitinių negalima vienareikšmiškai išdėstyti, todėl ten užfiksuotas variantas gali būti praleistas arba klaidingas. Svoris 100 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kitose genomo vietose esančios kopijos, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kurių tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Svoris 60 %.0 %
- Nuorodinio genomo padengimasNetoliese esantys nuorodinio genomo surinkimo tarpai, kur nėra sekos, prie kurios skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris 50 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido ilgos sekos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti jų visų. Svoris 30 %.5,6 %
- GC kiekisLangai, kuriuose G ir C yra mažiau nei 25 % arba daugiau nei 65 %; bibliotekos paruošimas juos apima silpnai. Svoris 20 %.16 %
„Dante Labs“ įvertinimas, sukurtas mūsų tyrimų pagrindu, remiantis NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojamaKiekviena juosta rodo geno KCNJ8 eksonų bazių dalį tokio tipo sunkiose srityse. Bet kuri viena rūšis gali pati savaime padaryti geną sunkiai sekvenuojamą, o kiekviena papildoma rūšis prideda vis mažiau: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokią, 100, kai visos bazės yra vietose, kur skaitiniai negali būti vienareikšmiškai išdėstyti.
1
pozicija gene KCNJ8, kurioje ClinVar pakitimą priskiria patogeniniam arba tikriausiai patogeniniam
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomas apima visus 9,8 kb geno KCNJ8, įskaitant intronus, o ne tik 2,3 kb eksonų.
ClinVar pathogenic variants (1)
The KCNJ8 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Tikriausiai patogeninis 1
| Variantas | Conditions | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|
| NM_004982.4(KCNJ8):c.712G>A (p.Gly238Arg) (opens in a new tab) | hypertrichotic osteochondrodysplasia Cantu type | Tikriausiai patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
Savybės, susijusios su KCNJ8
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti KCNJ8, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal skeletal development
- Broad ribs
- Cuboid-shaped vertebral bodies
- Delayed bone maturation
- Flattened vertebrae
- Narrow chest
- Osteoporosis
- Ovoid vertebral bodies
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-19: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.19-9814e911.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). KCNJ8 genas: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 8. Pasiekta 2026 m. spalio 19 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/kcnj8
Dante Labs. KCNJ8 genas: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 8 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 19 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/kcnj8
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites