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Gène

SCN10A

sodium voltage-gated channel alpha subunit 10

Résumé

Localisation cytogénétique
3p22.2
Coordonnées
Chromosome 3 : 38 696 807–38 816 217 (GRCh38)
Exons
28 exons sur 119,4 kb
Protéine
1 956 acides aminés
Aussi appelé
Nav1.8, hPN3, SNS, PN3
Transcrit MANE Select
ENST00000449082.3NM_006514.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SCN10A. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SCN10A

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de SCN10A. SCN10A et 12 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 38 256 512 à 39 256 511.Chromosome 33p22.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2938,4 Mb38,6 Mb38,8 Mb39 Mb39,2 MbSLC22A13 : 38 265 812–38 278 757, brin directSLC22A13SLC22A14 : 38 282 294–38 318 575, brin directSLC22A14XYLB : 38 346 743–38 428 434, brin directXYLBACVR2B : 38 453 843–38 493 142, brin directACVR2BEXOG : 38 496 127–38 542 242, brin directEXOGSCN5A : 38 548 057–38 649 743, brin inverseSCN5ASCN10A : 38 696 807–38 816 217, brin inverseSCN10ASCN11A : 38 845 758–39 052 157, brin inverseSCN11AWDR48 : 39 051 991–39 096 671, brin directWDR48GORASP1 : 39 095 222–39 108 369, brin inverseGORASP1TTC21A : 39 107 194–39 140 973, brin directTTC21ACSRNP1 : 39 141 854–39 154 852, brin inverseCSRNP1XIRP1 : 39 183 210–39 192 660, brin inverseXIRP1Schéma de SCN10A : 28 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 25 : 1 site connu associé à une maladieExon 15 : 1 site connu associé à une maladieExon 28 : 38 696 807–38 698 562, 1 756 basesExon 27 : 38 701 839–38 702 109, 271 basesExon 26 : 38 707 279–38 707 383, 105 basesExon 25 : 38 709 478–38 709 615, 138 basesExon 24 : 38 710 844–38 710 897, 54 basesExon 23 : 38 712 161–38 712 445, 285 basesExon 22 : 38 713 958–38 714 080, 123 basesExon 21 : 38 718 653–38 718 826, 174 basesExon 20 : 38 722 258–38 722 412, 155 basesExon 19 : 38 723 430–38 723 553, 124 basesExon 18 : 38 725 174–38 725 314, 141 basesExon 17 : 38 726 606–38 727 052, 447 basesExon 16 : 38 728 542–38 728 901, 360 basesExon 15 : 38 739 515–38 739 688, 174 basesExon 14 : 38 742 291–38 742 529, 239 basesExon 13 : 38 750 073–38 750 184, 112 basesExon 12 : 38 752 219–38 752 512, 294 basesExon 11 : 38 755 788–38 755 958, 171 basesExon 10 : 38 756 674–38 756 871, 198 basesExon 9 : 38 757 018–38 757 159, 142 basesExon 8 : 38 760 681–38 760 747, 67 basesExon 7 : 38 761 192–38 761 383, 192 basesExon 6 : 38 763 505–38 763 596, 92 basesExon 5 : 38 771 279–38 771 407, 129 basesExon 4 : 38 788 956–38 789 036, 81 basesExon 3 : 38 792 050–38 792 168, 119 basesExon 2 : 38 793 741–38 794 042, 302 basesExon 1 : 38 816 037–38 816 217, 181 bases28262422201816141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6,6 kb sur les 119,4 kb du gène ; 5 871 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SCN10A

2

positions dans SCN10A où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 119,4 kb de SCN10A, introns compris, et pas seulement les 6,6 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SCN10A : sodium voltage-gated channel alpha subunit 10. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/scn10a

Vancouver

Dante Labs. Gène SCN10A : sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/scn10a

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