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Gène

TTC21A

tetratricopeptide repeat domain 21A

Résumé

Localisation cytogénétique
3p22.2
Coordonnées
Chromosome 3 : 39 107 680–39 138 900 (GRCh38)
Exons
29 exons sur 31,2 kb
Protéine
1 313 acides aminés
Aussi appelé
STI2, IFT139A, Thm2
Transcrit MANE Select
ENST00000683103.1NM_001366900.1
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

  • Infertilité masculine

    • Incapacité pour l'homme de féconder un ovocyte après une période donnée de rapports sexuels non protégés. La stérilité masculine correspond à une infertilité permanente.

      • 1 soumetteur GenCC le classe comme définitif ou fort

Structure de TTC21A

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de TTC21A. TTC21A et 12 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 38 623 290 à 39 623 289.Chromosome 33p22.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2938,8 Mb39 Mb39,2 Mb39,4 Mb39,6 MbSCN5A : 38 548 057–38 649 743, brin inverseSCN5ASCN10A : 38 696 802–38 816 286, brin inverseSCN10ASCN11A : 38 845 758–39 052 157, brin inverseSCN11AWDR48 : 39 051 991–39 096 671, brin directWDR48GORASP1 : 39 095 222–39 108 369, brin inverseGORASP1TTC21A : 39 107 680–39 138 900, brin directTTC21ACSRNP1 : 39 141 854–39 154 852, brin inverseCSRNP1XIRP1 : 39 183 210–39 192 660, brin inverseXIRP1CX3CR1 : 39 263 495–39 281 735, brin inverseCX3CR1CCR8 : 39 329 709–39 336 269, brin directCCR8SLC25A38 : 39 383 292–39 397 426, brin directSLC25A38RPSA : 39 406 709–39 426 255, brin directRPSAMOBP : 39 467 172–39 529 479, brin directMOBPSchéma de TTC21A : 29 exons sur le brin direct du chromosome 3Exon 1 : 39 107 680–39 107 864, 185 basesExon 2 : 39 109 085–39 109 214, 130 basesExon 3 : 39 110 029–39 110 139, 111 basesExon 4 : 39 110 851–39 111 017, 167 basesExon 5 : 39 112 458–39 112 580, 123 basesExon 6 : 39 114 585–39 114 742, 158 basesExon 7 : 39 118 069–39 118 153, 85 basesExon 8 : 39 119 922–39 120 020, 99 basesExon 9 : 39 120 997–39 121 189, 193 basesExon 10 : 39 125 063–39 125 160, 98 basesExon 11 : 39 125 332–39 125 532, 201 basesExon 12 : 39 126 261–39 126 390, 130 basesExon 13 : 39 128 331–39 128 488, 158 basesExon 14 : 39 128 717–39 128 932, 216 basesExon 15 : 39 129 072–39 129 310, 239 basesExon 16 : 39 130 079–39 130 151, 73 basesExon 17 : 39 130 248–39 130 358, 111 basesExon 18 : 39 130 701–39 130 839, 139 basesExon 19 : 39 130 992–39 131 095, 104 basesExon 20 : 39 133 052–39 133 240, 189 basesExon 21 : 39 134 218–39 134 328, 111 basesExon 22 : 39 135 093–39 135 174, 82 basesExon 23 : 39 136 357–39 136 507, 151 basesExon 24 : 39 136 899–39 137 060, 162 basesExon 25 : 39 137 195–39 137 387, 193 basesExon 26 : 39 137 486–39 137 710, 225 basesExon 27 : 39 138 267–39 138 387, 121 basesExon 28 : 39 138 556–39 138 623, 68 basesExon 29 : 39 138 711–39 138 900, 190 bases1510152025295′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,2 kb sur les 31,2 kb du gène ; 3 942 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit TTC21A

4

positions dans TTC21A où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 31,2 kb de TTC21A, introns compris, et pas seulement les 4,2 kb d'exons.

Gènes liés aux mêmes affections

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TTC21A : tetratricopeptide repeat domain 21A. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ttc21a

Vancouver

Dante Labs. Gène TTC21A : tetratricopeptide repeat domain 21A [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ttc21a

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