Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SCN10A

sodium voltage-gated channel alpha subunit 10

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
3p22.2
Koordinaadid
Kromosoom 3: 38 696 807–38 816 217 (GRCh38)
Eksonid
28 eksonit, ulatus 119,4 kb
Valk
1956 aminohapet
Tuntud ka kui
Nav1.8, hPN3, SNS, PN3
MANE Select transkript
ENST00000449082.3NM_006514.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SCN10A veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SCN10A on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 3, millel on sulg kohal, kus asub SCN10A. SCN10A ja sellele lähedal asuvad 12 geeni kromosoomil 3, vahemikus 38 256 512 kuni 39 256 511.Kromosoom 33p22.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2938,4 Mb38,6 Mb38,8 Mb39 Mb39,2 MbSLC22A13: 38 265 812–38 278 757, otsene ahelSLC22A13SLC22A14: 38 282 294–38 318 575, otsene ahelSLC22A14XYLB: 38 346 743–38 428 434, otsene ahelXYLBACVR2B: 38 453 843–38 493 142, otsene ahelACVR2BEXOG: 38 496 127–38 542 242, otsene ahelEXOGSCN5A: 38 548 057–38 649 743, pöördne ahelSCN5ASCN10A: 38 696 807–38 816 217, pöördne ahelSCN10ASCN11A: 38 845 758–39 052 157, pöördne ahelSCN11AWDR48: 39 051 991–39 096 671, otsene ahelWDR48GORASP1: 39 095 222–39 108 369, pöördne ahelGORASP1TTC21A: 39 107 194–39 140 973, otsene ahelTTC21ACSRNP1: 39 141 854–39 154 852, pöördne ahelCSRNP1XIRP1: 39 183 210–39 192 660, pöördne ahelXIRP1SCN10A skeem: 28 eksonit kromosoomi 3 pöördne ahelalEkson 25: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 28: 38 696 807–38 698 562, 1756 alustEkson 27: 38 701 839–38 702 109, 271 alustEkson 26: 38 707 279–38 707 383, 105 alustEkson 25: 38 709 478–38 709 615, 138 alustEkson 24: 38 710 844–38 710 897, 54 alustEkson 23: 38 712 161–38 712 445, 285 alustEkson 22: 38 713 958–38 714 080, 123 alustEkson 21: 38 718 653–38 718 826, 174 alustEkson 20: 38 722 258–38 722 412, 155 alustEkson 19: 38 723 430–38 723 553, 124 alustEkson 18: 38 725 174–38 725 314, 141 alustEkson 17: 38 726 606–38 727 052, 447 alustEkson 16: 38 728 542–38 728 901, 360 alustEkson 15: 38 739 515–38 739 688, 174 alustEkson 14: 38 742 291–38 742 529, 239 alustEkson 13: 38 750 073–38 750 184, 112 alustEkson 12: 38 752 219–38 752 512, 294 alustEkson 11: 38 755 788–38 755 958, 171 alustEkson 10: 38 756 674–38 756 871, 198 alustEkson 9: 38 757 018–38 757 159, 142 alustEkson 8: 38 760 681–38 760 747, 67 alustEkson 7: 38 761 192–38 761 383, 192 alustEkson 6: 38 763 505–38 763 596, 92 alustEkson 5: 38 771 279–38 771 407, 129 alustEkson 4: 38 788 956–38 789 036, 81 alustEkson 3: 38 792 050–38 792 168, 119 alustEkson 2: 38 793 741–38 794 042, 302 alustEkson 1: 38 816 037–38 816 217, 181 alust28262422201816141210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 6,6 kb kogupikkusega 119,4 kb; neist 5871 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse SCN10A

2

kohad geenis SCN10A, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SCN10A 119,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (6,6 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SCN10A geen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 10. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/scn10a

Vancouver

Dante Labs. SCN10A geen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/scn10a

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test