Geeni
SFTPA1
surfactant protein A1
- HGNC 10798↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000122852↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 653509↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 10q22.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 10: 79 610 939–79 615 443 (GRCh38)
- Eksonit
- 6 eksonia 4,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 248 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- SP-A, SP-A1, COLEC4
- Aiemmat symbolit
- SFTP1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000398636.8NM_005411.5
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sftpa1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue SFTPA1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnöllinen keuhkofibroosi
- Interstitiaalinen keuhkosairaus 1 (SFTPA1-geeniin liittyvä)Autosomaalinen dominantti
Surfaktanttiproteiini A1 -geenin (SFTPA1) variantit voivat aiheuttaa perinnöllistä keuhkofibroosia, ja joissakin suvuissa myös keuhkosyöpää.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: kohtalainen
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
SFTPA1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,2 kb geenin 4,5 kb:stä; 747 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Geeniin SFTPA1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SFTPA1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Abnormality in area between air sacs in lung
- Cough
- Crackles
- Decreased DLCO
- Elevated bronchoalveolar lavage fluid eosinophil proportion
- Elevated bronchoalveolar lavage fluid neutrophil proportion
- Exertional breathlessness
Näytä 13 piirrettä lisää
- Ground-glass opacification
- Honeycomb lung
- Interlobular septal thickening
- Nonspecific interstitial pneumonia
- Permanent enlargement of the airways of the lungs
- Pulmonary scarring
- Reduced forced vital capacity
- Reticular pattern on pulmonary HRCT
- Stiff lung or chest wall causing decreased lung volume
- Subpleural honeycombing
- Usual interstitial pneumonia
- Intralobular septal thickening
- Orthodeoxia
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SFTPA1-geeni: surfactant protein A1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/sftpa1
Dante Labs. SFTPA1-geeni: surfactant protein A1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/sftpa1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa