Geen
SFTPA1
surfactant protein A1
- HGNC 10798↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000122852↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 653509↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 10q22.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 10: 79 610 939–79 615 443 (GRCh38)
- Eksonid
- 6 eksonit, ulatus 4,5 kb
- Valk
- 248 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- Tuntud ka kui
- SP-A, SP-A1, COLEC4
- Varasemad tähised
- SFTP1
- MANE Select transkript
- ENST00000398636.8NM_005411.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe SFTPA1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Familiaarne pulmonaalne fibroos
- Interstitsiaalne kopsuhaigus 1 (seotud SFTPA1-ga)Autosoomne dominantne
Surfaktantvalgu A1 geeni (SFTPA1) variandid võivad põhjustada familiaarset pulmonaalset fibroosi ning mõnedes perekondades kopsuvähki.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: mõõdukas
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas SFTPA1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,2 kb kogupikkusega 4,5 kb; neist 747 alust kodeerivad valku.
Geeniga SFTPA1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SFTPA1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Abnormality in area between air sacs in lung
- Cough
- Crackles
- Decreased DLCO
- Elevated bronchoalveolar lavage fluid eosinophil proportion
- Elevated bronchoalveolar lavage fluid neutrophil proportion
- Exertional breathlessness
Näita veel 13 tunnust
- Ground-glass opacification
- Honeycomb lung
- Interlobular septal thickening
- Nonspecific interstitial pneumonia
- Permanent enlargement of the airways of the lungs
- Pulmonary scarring
- Reduced forced vital capacity
- Reticular pattern on pulmonary HRCT
- Stiff lung or chest wall causing decreased lung volume
- Subpleural honeycombing
- Usual interstitial pneumonia
- Intralobular septal thickening
- Orthodeoxia
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SFTPA1 geen: surfactant protein A1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/sftpa1
Dante Labs. SFTPA1 geen: surfactant protein A1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/sftpa1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast