Geeni
IL7R
interleukin 7 receptor
- HGNC 6024↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000168685↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3575↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 5p13.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 5: 35 856 891–35 879 603 (GRCh38)
- Eksonit
- 8 eksonia 22,7 kb:n alueella
- Proteiini
- 459 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- CD127, IL7RA, lnc-IL7R, IL-7Ralpha, IL7Ralpha, sIL-7R, CDw127
- MANE Select -transkripti
- ENST00000303115.8NM_002185.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue IL7R ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Vakava yhdistynyt immuunipuutos
- Autosomaalinen resessiivinen
Vakava yhdistynyt immuunipuutos (SCID) on ryhmä harvinaisia monogeenisiä primaarisia immuunipuutossairauksia, joille on ominaista toimivien perifeeristen T-lymfosyyttien puute. Tämä johtaa varhaisessa iässä alkaviin vakavoihin hengitystieinfektioihin ja kasvun häiriintymiseen. Sairaudet luokitellaan immunologisen fenotyypin mukaan SCID-muotoihin, joissa T-solut puuttuvat mutta B-solut ovat läsnä (T-B+ SCID), tai SCID-muotoihin, joissa sekä T- että B-solut puuttuvat (T-B- SCID). Molemmat ryhmät sisältävät useita muotoja, joissa luonnollisia tappajasoluja (NK-soluja) voi olla tai ei ole.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Immuunipuutossairaus
Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä
Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
IL7R-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,6 kb geenin 22,7 kb:stä; 1 380 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä IL7R
53
IL7R-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 22,7 kb geenistä IL7R, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,6 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (15)
Tässä ovat IL7R-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| c.83-2A>T | Introni 1 | 35 860 850 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.221+1G>A | Introni 2 | 35 860 991 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.221+2T>G | Introni 2 | 35 860 992 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.537+1G>A | Introni 4 | 35 871 214 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.538-1G>A | Introni 4 | 35 873 479 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| C118Y | c.353G>A | Eksoni 3 | 35 867 437 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| E79X | c.235G>T | Eksoni 3 | 35 867 319 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| I121Nfs*8 | c.361dup | Eksoni 3 | 35 867 438 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| K119X | c.355A>T | Eksoni 3 | 35 867 439 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| P132S | c.394C>T | Eksoni 4 | 35 871 070 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ADAadenosine deaminaseYhteisiä sairauksia: 2
- AK2adenylate kinase 2Yhteisiä sairauksia: 2
- BCL11BBCL11 transcription factor BYhteisiä sairauksia: 2
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Yhteisiä sairauksia: 2
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Yhteisiä sairauksia: 2
- CD247CD247 moleculeYhteisiä sairauksia: 2
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexYhteisiä sairauksia: 2
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexYhteisiä sairauksia: 2
- CD70CD70 moleculeYhteisiä sairauksia: 2
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorYhteisiä sairauksia: 2
- CORO1Acoronin 1AYhteisiä sairauksia: 2
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin IL7R liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita IL7R voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). IL7R-geeni: interleukin 7 receptor. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/il7r
Dante Labs. IL7R-geeni: interleukin 7 receptor [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/il7r
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa