Geen
PUS1
pseudouridine synthase 1
- HGNC 15508↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000177192↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 80324↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 12q24.33
- Koordinaadid
- Kromosoom 12: 131 929 276–131 945 896 (GRCh38)
- Eksonid
- 6 eksonit, ulatus 16,6 kb
- Valk
- 427 aminohapet
- Tuntud ka kui
- MLASA1
- MANE Select transkript
- ENST00000376649.8NM_025215.6
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pus1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe PUS1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Pärilikud sideroblastsed aneemiad
- Pärilik sideroblastne aneemia
Haiguste rühm, mida põhjustavad muutused geenides nagu ALAS2 ja ABCB7 (X-seotud), SLC25A38, GLRX5, PUS1, YARS2 ja TRNT1 (retsessiivsed) ning HSPA9 (dominantne); mõned vormid mõjutavad ka lihaseid, närvisüsteemi või immuunsüsteemi.
- 4 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
X-seotud ALAS2 vorm reageerib sageli vitamiin B6-le (püridoksiinile) ning diagnoos juhib rauaülekoormuse jälgimist ja eristab neid haigusi omandatud müelodüsplastilisest sündroomist.
Kuidas PUS1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4 kb kogupikkusega 16,6 kb; neist 1284 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: PUS1
58
PUS1 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu PUS1 geeni 16,6 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 4 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Jagab 1 haigust
- ALAS25'-aminolevulinate synthase 2Jagab 1 haigust
- GLRX5glutaredoxin 5Jagab 1 haigust
- HSPA9heat shock protein family A (Hsp70) member 9Jagab 1 haigust
- SLC25A38solute carrier family 25 member 38Jagab 1 haigust
- TRNT1tRNA nucleotidyl transferase 1Jagab 1 haigust
- YARS2tyrosyl-tRNA synthetase 2Jagab 1 haigust
Geeniga PUS1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PUS1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PUS1 geen: pseudouridine synthase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pus1
Dante Labs. PUS1 geen: pseudouridine synthase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pus1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast