Gen
CAPN5
calpain 5
- HGNC 1482↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- Ensembl-Gen ENSG00000149260↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- NCBI Gene 726↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
Zusammenfassung
- Zytogenetische Lage
- 11q13.5
- Koordinaten
- Chromosom 11: 77.066.971–77.126.155 (GRCh38)
- Exons
- 13 Exons über 59,2 kb
- Protein
- 640 Aminosäuren
- Auch bekannt als
- nCL-3, HTRA3, ADNIV
- Frühere Symbole
- VRNI
- MANE-Select-Transkript
- ENST00000648180.1NM_004055.5
- Locus-Typ
- gene with protein product
- Sehr hoch
- Zuversichtlich
- Niedrig
- Sehr niedrig
ReferenzgenomGRCh38hg38
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Vitreoretinopathie
- Vitreoretinale Degeneration
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 3 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Aufbau von CAPN5
- Kodierende Sequenz
- Nicht translatierte Region
- Intron
- Transkriptionsrichtung
- Bekannte krankheitsverursachende Stellen
- Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.
Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).
Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.
Exons machen 4,4 kb der 59,2 kb des Gens aus; 1.923 dieser Basen kodieren für das Protein.
So liest ein Gentest CAPN5
1
Position in CAPN5, an der ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft
Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.
Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 59,2 kb von CAPN5, einschließlich der Introns, und nicht nur die 4,4 kb Exons.
Gene mit denselben Erkrankungen
- BEST1bestrophin 1Teilt 1 Erkrankung
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainTeilt 1 Erkrankung
- COL18A1collagen type XVIII alpha 1 chainTeilt 1 Erkrankung
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainTeilt 1 Erkrankung
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainTeilt 1 Erkrankung
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainTeilt 1 Erkrankung
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainTeilt 1 Erkrankung
- CTNNB1catenin beta 1Teilt 1 Erkrankung
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Teilt 1 Erkrankung
- FZD4frizzled class receptor 4Teilt 1 Erkrankung
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Teilt 1 Erkrankung
- LRP5LDL receptor related protein 5Teilt 1 Erkrankung
Mit CAPN5 verknüpfte Merkmale
Die Human Phenotype Ontology führt diese als Merkmale der seltenen Erkrankungen auf, die CAPN5 verursachen kann. Auf der Seite jedes Merkmals sind die anderen Gene aufgeführt, die damit in Verbindung stehen.
Externe Links
Gendatensätze
Transkript
Protein
Woher diese Angaben stammen
- HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
- MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
- GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
- Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
- ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
- Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
- Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Diese Seite zitieren
Dante Labs. (o. J.). CAPN5-Gen: calpain 5. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/capn5
Dante Labs. CAPN5-Gen: calpain 5 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/capn5
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