Gen
ALK
ALK receptor tyrosine kinase
- HGNC 427↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000171094↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 238↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2p23.2-p23.1
- Koordinater
- Kromosom 2: 29.192.774–29.921.586 (GRCh38)
- Exoner
- 29 exoner fordelt over 728,8 kb
- Protein
- 1.620 aminosyrer
- Også kendt som
- CD246, ALK1
- MANE Select-transkript
- ENST00000389048.8NM_004304.5
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/alk.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs ALK og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Prædisposition for neuroblastom (ALK og PHOX2B)
- Neuroblastom-modtagelighed 3 (ALK)Autosomal dominant
Kimlinje-varianter i ALK, der disponerer for neuroblastom i spædbarns- og barnealderen.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Abdominal ultralyd og måling af katekolaminer i urin i tidlig barndom.
Sådan er ALK opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 6,2 kb af genets 728,8 kb; 4.863 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af ALK
2
positioner i ALK, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte reads har svært ved at finde.
En hel genomsekventering dækker alle 728,8 kb af ALK, inklusive introns, og ikke kun de 6,2 kb af exons.
ClinVar pathogenic variants (2)
The ALK variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 2
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_004304.5(ALK):c.3824G>A (p.Arg1275Gln) (opens in a new tab) | hereditary neoplastic syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_004304.5(ALK):c.3575G>C (p.Arg1192Pro) (opens in a new tab) | neuroblastoma, susceptibility to, 3 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
Træk knyttet til ALK
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, ALK kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the digestive system
- Abdominal bloating
- Abdominal mass
- Chronic diarrhea
- Colorectal polyposis
- Multiple intestinal neurofibromatosis
- Functional intestinal obstruction
- Hamartomatous polyposis
- Intermittent abdominal pain
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-18: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.18-8b139e39.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). ALK-genet: ALK receptor tyrosine kinase. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/alk
Dante Labs. ALK-genet: ALK receptor tyrosine kinase [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/alk
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger