Gen
SLC1A2
solute carrier family 1 member 2
- HGNC 10940↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000110436↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6506↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11p13
- Koordinater
- Kromosom 11: 35 251 205–35 419 558 (GRCh38)
- Exoner
- 11 exoner på 168,4 kb
- Protein
- 574 aminosyror
- Även känd som
- GLT-1, GLT1, EAAT2, HBGT
- MANE Select-transkript
- ENST00000278379.9NM_004171.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SLC1A2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Epilepsi (fullständig panel)
- Epilepsi
En av 171 gener kopplade till den
En hjärnsjukdom som kännetecknas av episoder med onormalt ökad neuronal urladdning, vilket ger övergående episoder av sensoriska eller motoriska neurologiska störningar eller psykiska störningar. Dessa episoder kan, men behöver inte, vara förknippade med medvetslöshet eller krampanfall.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Så är SLC1A2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 12 kb av genens 168,4 kb, och 1 725 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SLC1A2
6
positioner i SLC1A2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 168,4 kb av SLC1A2, med introner inräknade, inte bara de 12 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Delar 1 tillstånd
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDelar 1 tillstånd
- ACTL6Bactin like 6BDelar 1 tillstånd
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Delar 1 tillstånd
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Delar 1 tillstånd
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDelar 1 tillstånd
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDelar 1 tillstånd
- ARXaristaless related homeoboxDelar 1 tillstånd
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Delar 1 tillstånd
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SLC1A2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC1A2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- EEG abnormality
- Epileptic encephalopathy
- Global developmental delay
- Myoclonic seizure
- Encephalopathy
- Abnormality of coordination
- Babinski sign
- Decreased reflex response
Visa ytterligare 39 egenskaper
- Degeneration of cerebrum
- Delayed CNS myelination
- Delayed speech and language development
- EEG with multifocal slow activity
- Epilepsy
- Epileptic spasm
- Focal tonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Grand mal seizures
- Hypsarrhythmia
- Intellectual disability
- Intellectual disability, severe
- IQ less than 20
- Loss of developmental milestones
- Myoclonic status epilepticus
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Tetraparesis
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Impulsivity
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Tremor
- Unsteady walk
- Repeated seizures without recovery between them
- Absent speech development
- Inability to walk
- Irritability
- Lethargy
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SLC1A2-genen: solute carrier family 1 member 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc1a2
Dante Labs. SLC1A2-genen: solute carrier family 1 member 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc1a2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor