Gen
SLC6A9
solute carrier family 6 member 9
- HGNC 11056↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000196517↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6536↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 1p34.1
- Coördinaten
- Chromosoom 1: 43.996.483–44.031.462 (GRCh38)
- Exons
- 14 exons over 35 kb
- Eiwit
- 633 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal recessief
- Ook bekend als
- GLYT1, GlyT-1
- MANE Select-transcript
- ENST00000372310.8NM_001024845.3
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc6a9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SLC6A9 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Erfelijke stoornissen van glycine- en serinestofwisseling
- Glycine-encefalopathie (niet-ketotische hyperglycinemie)Autosomaal recessief
Veroorzaakt door varianten in GLDC, AMT of GCSH (en, bij een atypische vorm, SLC6A9), die leiden tot een hoog glycinegehalte in de hersenen en kunnen resulteren in epileptische aanvallen, lage spierspanning en ontwikkelingsproblemen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Actionability
Met deze kennis kan behandeling met natriumbenzoaat en dextromethorfan worden overwogen, die bij sommige vormen het aantal epileptische aanvallen kunnen verminderen.
Overerving
- Autosomaal recessief
- Er is een veranderde kopie van elke ouder nodig. Met één bent u drager en meestal niet aangedaan. Wanneer beide ouders dragers zijn, heeft elk kind een kans van één op vier om er twee te erven.
Opbouw van SLC6A9
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,2 kb van de 35 kb van het gen; 1.902 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SLC6A9
10
posities in SLC6A9 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 35 kb van SLC6A9, inclusief intronen, en niet alleen de 3,2 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
Kenmerken gekoppeld aan SLC6A9
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SLC6A9 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SLC6A9-gen: solute carrier family 6 member 9. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/slc6a9
Dante Labs. SLC6A9-gen: solute carrier family 6 member 9 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/slc6a9
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken