Gen
SLC6A9
solute carrier family 6 member 9
- HGNC 11056↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000196517↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 6536↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 1p34.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 43.996.483–44.031.462 (GRCh38)
- Exoner
- 14 exoner fordelt over 35 kb
- Protein
- 633 aminosyrer
- Også kendt som
- GLYT1, GlyT-1
- MANE Select-transkript
- ENST00000372310.8NM_001024845.3
- Lokustype
- Protein-coding
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc6a9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs SLC6A9 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Arvelige sygdomme i glycin- og serinstofskiftet
- Glycinencephalopati (ikke-ketotisk hyperglycinæmi)Autosomal recessiv
Forårsaget af varianter i GLDC, AMT eller GCSH (og i en atypisk form SLC6A9), som giver højt glycinindhold i hjernen og kan føre til krampeanfald, lav muskelspænding og udviklingsforsinkelse.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Viden gør det muligt at behandle med natriumbenzoat og dextromethorphan, som kan reducere krampeanfald ved nogle former.
Sådan er SLC6A9 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 3,2 kb af genets 35 kb; 1.902 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af SLC6A9
10
positioner i SLC6A9, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved at dække.
En helgenomsanalyse dækker alle 35 kb af SLC6A9, inklusive introner, og ikke kun de 3,2 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
Træk knyttet til SLC6A9
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SLC6A9 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SLC6A9-genet: solute carrier family 6 member 9. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/slc6a9
Dante Labs. SLC6A9-genet: solute carrier family 6 member 9 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/slc6a9
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger