Genas
CTNNA1
catenin alpha 1
- HGNC 2509↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000044115↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 1495↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 5q31.2
- Koordinatės
- Chromosoma 5: 138 753 425–138 935 034 (GRCh38)
- Eksonai
- 18 eksonų per 181,6 kb
- Baltymas
- 906 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- CAP102
- MANE Select transkriptas
- ENST00000302763.12NM_001903.5
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ctnna1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite CTNNA1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Paveldimas difuzinis skrandžio vėžys
- CTNNA1 sąlygotas difuzinio skrandžio ir lobulinio krūties vėžio sindromasAutosominis dominantinis
CTNNA1 variantai, didinantys difuzinio skrandžio vėžio ir lobulinio krūties vėžio riziką.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Paprastai rekomenduojama endoskopinė stebėsena ir krūties patikra.
Krūties ir kiaušidžių vėžio genai, išskyrus BRCA1/2
- Paveldimas krūties vėžysAutosominis dominantinis
Paveldimas polinkis į krūties vėžį, kurį sukelia vieno iš kelių genų variantai.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Priklausomai nuo geno, gali būti rekomenduojama anksčiau ir intensyviau tirti krūtis, įskaitant MRT.
Kaip išdėstytas CTNNA1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 3,8 kb iš 181,6 kb geno; 2 721 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: CTNNA1
1Maža
Kiek sunku sekti CTNNA1 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo CTNNA1 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.2,1 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.2,3 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
100
CTNNA1 pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 181,6 kb geno CTNNA1, įskaitant intronus, o ne tik 3,8 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
Savybės, susijusios su CTNNA1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti CTNNA1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). CTNNA1 genas: catenin alpha 1. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/ctnna1
Dante Labs. CTNNA1 genas: catenin alpha 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/ctnna1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites