Gén
FOLR1
folate receptor alpha
- HGNC 3791↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000110195↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 2348↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 11q13.4
- Koordináták
- 11. kromoszóma: 72 192 140–72 196 299 (GRCh38)
- Exonok
- 4 exon, összesen 4,2 kb
- Fehérje
- 257 aminosav
- Más néven ismert
- FRα
- Korábbi jelölések
- FOLR
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000393676.5NM_016729.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/folr1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a FOLR1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Homocystinuria & Cobalamin Disorders
- Cerebral Folate Transport DeficiencyAutoszomális recesszív
Caused by variants in FOLR1, which prevent folate from reaching the brain and can cause developmental regression, movement problems and seizures in early childhood.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing allows treatment with folinic acid, which can improve or prevent neurological symptoms when started early.
Átfogóbb csoportosítások
Inherited Neurodegenerative Disorders
- KIF5A-Related Neurodegenerative DisorderAutoszomális domináns
A 372 hozzá kapcsolódó gén egyike
Caused by changes in one copy of KIF5A, which encodes a motor protein with a cargo-binding tail. Different types of change lead to different conditions: hereditary spastic paraplegia type 10, an axonal form of Charcot-Marie-Tooth disease and amyotrophic lateral sclerosis (ALS).
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Care is symptomatic and depends on the presentation, including physiotherapy, antispasticity medicines and multidisciplinary ALS care. Each child of an affected person has a 1 in 2 chance of inheriting the change; genetic counselling helps families understand this.
A FOLR1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 4,2 kb-jából 0,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 774 bázis kódolja a fehérjét.
FOLR1 szekvenálása
0Könnyű
Mennyire nehéz a FOLR1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A FOLR1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ehhez hozzájárul: a FOLR1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.0%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.0%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a FOLR1 exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
22
a FOLR1 azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a FOLR1 mind a 4,2 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 0,9 kb exont.
ClinVar pathogenic variants (23)
The FOLR1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 15
- Patogén/valószínűleg patogén 3
- Valószínűleg patogén 5
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_016729.3(FOLR1):c.352C>T (p.Gln118Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_016729.3(FOLR1):c.373C>T (p.Arg125Cys) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_016729.3(FOLR1):c.465_466delinsTG (p.Trp156Gly) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_016729.3(FOLR1):c.610C>T (p.Arg204Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_016729.3(FOLR1):c.181_182del (p.Arg61fs) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.197G>A (p.Cys66Tyr) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.257G>A (p.Trp86Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.258G>A (p.Trp86Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.321C>A (p.Tyr107Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.327C>A (p.Cys109Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.330_333dup (p.Asn112fs) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.379G>T (p.Glu127Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.421C>T (p.Gln141Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.428G>A (p.Trp143Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.496_514del (p.Phe166fs) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.525C>A (p.Cys175Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.584_587del (p.His195fs) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.621_622delinsT (p.Arg208fs) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.172C>T (p.Arg58Ter) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.358-2A>G (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.466dup (p.Trp156fs) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.466T>G (p.Trp156Gly) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_016729.3(FOLR1):c.590A>G (p.Tyr197Cys) (opens in a new tab) | neurodegenerative syndrome due to cerebral folate transport deficiency | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 betegséget oszt meg
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial1 betegséget oszt meg
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 71 betegséget oszt meg
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 11 betegséget oszt meg
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipase1 betegséget oszt meg
- ACER3alkaline ceramidase 31 betegséget oszt meg
- ACO2aconitase 21 betegséget oszt meg
- ADARadenosine deaminase RNA specific1 betegséget oszt meg
- ADPRSADP-ribosylserine hydrolase1 betegséget oszt meg
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 21 betegséget oszt meg
- AGTPBP1ATP/GTP binding carboxypeptidase 11 betegséget oszt meg
- AHI1Abelson helper integration site 11 betegséget oszt meg
A(z) FOLR1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) FOLR1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). FOLR1 gén: folate receptor alpha. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/folr1
Dante Labs. FOLR1 gén: folate receptor alpha [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/folr1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt