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Gène

RTTN

rotatin

Résumé

Localisation cytogénétique
18q22.2
Coordonnées
Chromosome 18 : 70 003 031–70 205 687 (GRCh38)
Exons
49 exons sur 202,7 kb
Protéine
2 226 acides aminés
Aussi appelé
DKFZP434G145
Transcrit MANE Select
ENST00000640769.2NM_173630.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RTTN. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RTTN

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 18, avec un crochet à l'emplacement de RTTN. RTTN et 3 gènes à proximité sur le chromosome 18, de 69 604 359 à 70 604 358.Chromosome 1818q22.2p11.32p11.31p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q2369,8 Mb70 Mb70,2 Mb70,4 Mb70,6 MbDOK6 : 69 400 741–69 849 087, brin directDOK6CD226 : 69 831 158–69 961 803, brin inverseCD226RTTN : 70 003 031–70 205 687, brin inverseRTTNSOCS6 : 70 288 876–70 330 199, brin directSOCS6Schéma de RTTN : 49 exons sur le brin inverse du chromosome 18Exon 44 : 1 site connu associé à une maladieExon 43 : 1 site connu associé à une maladieExon 42 : 1 site connu associé à une maladieExon 30 : 2 sites connus associés à une maladieExon 27 : 1 site connu associé à une maladieExon 26 : 1 site connu associé à une maladieExon 23 : 2 sites connus associés à une maladieExon 14 : 1 site connu associé à une maladieExon 13 : 1 site connu associé à une maladieExon 12 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 4 : 3 sites connus associés à une maladieExon 2 : 2 sites connus associés à une maladieExon 49 : 70 003 031–70 004 236, 1 206 basesExon 48 : 70 005 198–70 005 267, 70 basesExon 47 : 70 006 381–70 006 484, 104 basesExon 46 : 70 017 407–70 017 674, 268 basesExon 45 : 70 020 615–70 020 817, 203 basesExon 44 : 70 024 722–70 024 848, 127 basesExon 43 : 70 028 724–70 028 801, 78 basesExon 42 : 70 030 012–70 030 109, 98 basesExon 41 : 70 030 876–70 030 981, 106 basesExon 40 : 70 047 971–70 048 188, 218 basesExon 39 : 70 051 411–70 051 548, 138 basesExon 38 : 70 054 131–70 054 284, 154 basesExon 37 : 70 057 742–70 057 832, 91 basesExon 36 : 70 059 850–70 060 042, 193 basesExon 35 : 70 065 829–70 065 922, 94 basesExon 34 : 70 073 906–70 073 994, 89 basesExon 33 : 70 075 352–70 075 541, 190 basesExon 32 : 70 086 613–70 086 684, 72 basesExon 31 : 70 087 989–70 088 147, 159 basesExon 30 : 70 092 110–70 092 220, 111 basesExon 29 : 70 092 676–70 092 804, 129 basesExon 28 : 70 109 498–70 109 717, 220 basesExon 27 : 70 114 445–70 114 599, 155 basesExon 26 : 70 121 556–70 121 700, 145 basesExon 25 : 70 127 502–70 127 741, 240 basesExon 24 : 70 128 358–70 128 546, 189 basesExon 23 : 70 134 473–70 134 541, 69 basesExon 22 : 70 135 184–70 135 280, 97 basesExon 21 : 70 139 599–70 139 716, 118 basesExon 20 : 70 140 100–70 140 188, 89 basesExon 19 : 70 142 288–70 142 387, 100 basesExon 18 : 70 145 612–70 145 783, 172 basesExon 17 : 70 148 901–70 149 037, 137 basesExon 16 : 70 149 971–70 150 087, 117 basesExon 15 : 70 150 608–70 150 733, 126 basesExon 14 : 70 166 062–70 166 188, 127 basesExon 13 : 70 166 919–70 167 031, 113 basesExon 12 : 70 168 855–70 169 067, 213 basesExon 11 : 70 176 675–70 176 845, 171 basesExon 10 : 70 188 108–70 188 223, 116 basesExon 9 : 70 190 538–70 190 719, 182 basesExon 8 : 70 193 288–70 193 453, 166 basesExon 7 : 70 196 501–70 196 648, 148 basesExon 6 : 70 197 624–70 197 738, 115 basesExon 5 : 70 199 414–70 199 504, 91 basesExon 4 : 70 201 894–70 201 983, 90 basesExon 3 : 70 204 086–70 204 263, 178 basesExon 2 : 70 205 128–70 205 315, 188 basesExon 1 : 70 205 628–70 205 687, 60 bases494540353025201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7,8 kb sur les 202,7 kb du gène ; 6 681 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de RTTN

0Faible

Difficulté de séquençage de RTTN avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions2,6 %
  • Teneur en GC0,6 %
  • Couverture de référence0 %

28

positions dans RTTN où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à couvrir.

Un génome complet couvre les 202,7 kb de RTTN, introns compris, et pas seulement les 7,8 kb d'exons.

Traits associés à RTTN

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que RTTN peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Abnormality of the nervous system

Afficher 25 traits supplémentaires

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RTTN : rotatin. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rttn

Vancouver

Dante Labs. Gène RTTN : rotatin [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rttn

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