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Gène

PTPN6

protein tyrosine phosphatase non-receptor type 6

Résumé

Localisation cytogénétique
12p13.31
Coordonnées
Chromosome 12 : 6 951 356–6 961 316 (GRCh38)
Exons
16 exons sur 10 kb
Protéine
595 acides aminés
Aussi appelé
HCP, HCPH, PTP-1C, SHP-1, SHP1
Transcrit MANE Select
ENST00000318974.14NM_002831.6
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de PTPN6

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de PTPN6. PTPN6 et 43 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 6 456 336 à 7 456 335.Chromosome 1212p13.31p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.336,6 Mb6,8 Mb7 Mb7,2 Mb7,4 MbTAPBPL : 6 451 690–6 466 517, brin directTAPBPLVAMP1 : 6 462 237–6 470 948, brin inverseVAMP1MRPL51 : 6 490 204–6 493 856, brin inverseMRPL51NCAPD2 : 6 493 356–6 531 970, brin directNCAPD2GAPDH : 6 534 012–6 538 930, brin directGAPDHIFFO1 : 6 538 961–6 556 102, brin inverseIFFO1NOP2 : 6 556 863–6 568 691, brin inverseNOP2 : 6 556 886–6 607 367, brin inverseCHD4 : 6 570 081–6 614 982, brin inverseCHD4LPAR5 : 6 618 835–6 636 444, brin inverseLPAR5ACRBP : 6 638 075–6 647 441, brin inverseACRBPING4 : 6 650 282–6 663 180, brin inverseING4ZNF384 : 6 665 037–6 689 572, brin inverseZNF384PIANP : 6 693 791–6 700 859, brin inversePIANPCOPS7A : 6 724 014–6 732 462, brin directCOPS7AMLF2 : 6 747 986–6 768 932, brin inverseMLF2PTMS : 6 765 516–6 770 952, brin directPTMSLAG3 : 6 772 360–6 778 455, brin directLAG3CD4 : 6 786 858–6 820 807, brin directCD4GPR162 : 6 821 624–6 829 972, brin directP3H3 : 6 828 220–6 839 867, brin directGNB3 : 6 839 954–6 847 393, brin directGNB3CDCA3 : 6 844 723–6 852 353, brin inverseUSP5 : 6 852 098–6 866 632, brin directUSP5TPI1 : 6 867 119–6 878 513, brin directTPI1SPSB2 : 6 870 934–6 889 358, brin inverseSPSB2LRRC23 : 6 873 455–6 914 243, brin directENO2 : 6 913 745–6 923 970, brin directATN1 : 6 924 454–6 942 322, brin directC12orf57 : 6 942 919–6 946 009, brin directC12orf57RNU7-1 : 6 943 816–6 943 878, brin directRNU7-1PTPN6 : 6 951 356–6 961 316, brin directPTPN6PHB2 : 6 965 327–6 970 841, brin inversePHB2EMG1 : 6 970 765–6 979 939, brin direct : 6 970 921–6 997 428, brin directLPCAT3 : 6 972 027–7 018 779, brin inverseC1S : 6 988 259–7 071 281, brin directC1R : 7 080 213–7 092 873, brin inverseC1RC1RL : 7 089 587–7 109 245, brin inverseC1RLRBP5 : 7 115 736–7 128 891, brin inverseRBP5CLSTN3 : 7 128 077–7 158 945, brin directCLSTN3PEX5 : 7 188 653–7 218 574, brin directPEX5ACSM4 : 7 304 072–7 328 719, brin directACSM4CD163L1 : 7 346 685–7 479 897, brin inverseCD163L1Schéma de PTPN6 : 16 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 1 : 6 951 356–6 951 520, 165 basesExon 2 : 6 951 609–6 951 731, 123 basesExon 3 : 6 951 983–6 952 177, 195 basesExon 4 : 6 954 805–6 954 994, 190 basesExon 5 : 6 955 151–6 955 267, 117 basesExon 6 : 6 955 372–6 955 485, 114 basesExon 7 : 6 955 660–6 955 756, 97 basesExon 8 : 6 956 142–6 956 221, 80 basesExon 9 : 6 956 419–6 956 568, 150 basesExon 10 : 6 957 654–6 957 785, 132 basesExon 11 : 6 957 919–6 958 073, 155 basesExon 12 : 6 959 927–6 959 994, 68 basesExon 13 : 6 960 088–6 960 239, 152 basesExon 14 : 6 960 344–6 960 435, 92 basesExon 15 : 6 960 806–6 960 945, 140 basesExon 16 : 6 961 126–6 961 316, 191 bases12468101214165′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,2 kb sur les 10 kb du gène ; 1 788 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PTPN6 : protein tyrosine phosphatase non-receptor type 6. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptpn6

Vancouver

Dante Labs. Gène PTPN6 : protein tyrosine phosphatase non-receptor type 6 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptpn6

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