Geeni
HYDIN
HYDIN axonemal central pair apparatus protein
- HGNC 19368↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000157423↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 54768↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 16q22.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 16: 70 802 084–71 230 722 (GRCh38)
- Eksonit
- 86 eksonia 428,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 5 121 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- DKFZp434D0513, KIAA1864, PPP1R31, CILD5
- MANE Select -transkripti
- ENST00000393567.7NM_001270974.2
- Lokustyyppi
- gene with protein product
Lue HYDIN ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Primaarinen silialiikkeen häiriö
- Autosomaalinen resessiivinen
Harvinainen, geneettisesti heterogeeninen ja pääasiassa hengityselimiin vaikuttava sairaus, jolle on ominaista pitkittyneet ylä- ja alahengitysteiden sairaudet. Noin puolella primaarisen silialiikkeen häiriön potilaista esiintyy elinten sijoittumisen poikkeavuus (situs inversus totalis tai situs ambiguus/heterotaksia).
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
HYDIN-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 21 kb geenin 428,6 kb:stä; 15 366 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä HYDIN
62
HYDIN-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 59 (95 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (57 kohtaa)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (59 kohtaa)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Kokogenomi kattaa kaikki 428,6 kb geenistä HYDIN, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 21 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CCDC39coiled-coil domain 39 molecular ruler complex subunitYhteinen sairaus: 1
- CCDC40coiled-coil domain 40 molecular ruler complex subunitYhteinen sairaus: 1
- CCNOcyclin OYhteinen sairaus: 1
- CENPFcentromere protein FYhteinen sairaus: 1
- CFAP20DCCFAP20 domain containingYhteinen sairaus: 1
- CFAP221cilia and flagella associated protein 221Yhteinen sairaus: 1
- CFAP298cilia and flagella associated protein 298Yhteinen sairaus: 1
- CFAP300cilia and flagella associated protein 300Yhteinen sairaus: 1
- CFAP54cilia and flagella associated protein 54Yhteinen sairaus: 1
- CLXNcalaxinYhteinen sairaus: 1
- DAW1dynein assembly factor with WD repeats 1Yhteinen sairaus: 1
- DNAAF1dynein axonemal assembly factor 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin HYDIN liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita HYDIN voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). HYDIN-geeni: HYDIN axonemal central pair apparatus protein. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hydin
Dante Labs. HYDIN-geeni: HYDIN axonemal central pair apparatus protein [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hydin
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa