Geeni
EPM2A
EPM2A glucan phosphatase, laforin
- HGNC 3413↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000112425↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 7957↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 6q24.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 6: 145 625 305–145 735 520 (GRCh38)
- Eksonit
- 4 eksonia 110,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 331 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- LDE, LD
- MANE Select -transkripti
- ENST00000367519.9NM_005670.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Lue EPM2A ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Epilepsia (laaja paneeli)
- Epilepsia
Yksi 171 siihen liittyvästä geenistä
Aivosairaus, jolle on tyypillistä hermosolujen epänormaalin voimakkaan purkautumisen aiheuttamat jaksot. Ne aiheuttavat ohimeneviä aistihermoston tai motoriikan neurologisia toimintahäiriöitä tai psyykkisiä toimintahäiriöitä. Jaksoihin voi liittyä tajunnan menetys tai kouristuksia, mutta näin ei aina ole.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
EPM2A-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,1 kb geenin 110,2 kb:stä; 996 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä EPM2A
51
EPM2A-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 110,2 kb geenistä EPM2A, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,1 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseYhteinen sairaus: 1
- ACTL6Bactin like 6BYhteinen sairaus: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Yhteinen sairaus: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Yhteinen sairaus: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitYhteinen sairaus: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Yhteinen sairaus: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Yhteinen sairaus: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorYhteinen sairaus: 1
- ARXaristaless related homeoboxYhteinen sairaus: 1
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Yhteinen sairaus: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Yhteinen sairaus: 1
Geeniin EPM2A liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita EPM2A voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Focal sensory seizure with visual features
- Lafora bodies
- Epilepsy
- Abnormal gait
- Ataxia
- Can't control feelings
- Confusion
- Dementia
Näytä 25 piirrettä lisää
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Erratic myoclonus
- Generalized myoclonic seizure
- Giant somatosensory evoked potentials
- Headache
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Mental deterioration
- Repeated seizures without recovery between them
- Visual hallucinations
- Atypical absence seizure
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Brain degeneration
- Brief seizures with staring spells
- Difficulty sleeping
- Focal impaired awareness seizure
- Grand mal seizures
- Jerking
- Seizure affecting one half of brain
- Sudden loss of muscle tone
- Vegetative state
- Apraxia
- Psychosis
- Worsening neurological symptoms
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). EPM2A-geeni: EPM2A glucan phosphatase, laforin. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/epm2a
Dante Labs. EPM2A-geeni: EPM2A glucan phosphatase, laforin [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/epm2a
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa