Geeni
COL4A5
collagen type IV alpha 5 chain
- HGNC 2207↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000188153↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 1287↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- Xq22.3
- Koordinaatit
- Kromosomi X: 108 439 838–108 697 545 (GRCh38)
- Eksonit
- 53 eksonia 257,7 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 691 aminohappoa
- Aiemmat symbolit
- ASLN, ATS
- MANE Select -transkripti
- ENST00000328300.11NM_033380.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue COL4A5 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Alport-oireyhtymä
Harvinainen munuaissairaus, jolle on ominaista glomerulusnefropatia ja virtsaverisyys, joka etenee loppuvaiheen munuaissairauteen (ESRD), usein liittyen sensorineuraaliseen kuurouteen ja joskus silmäpoikkeavuuksiin.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
ACE-estäjät (ramipriili, ensisijainen hoito, mieluiten ennen proteinuriaa); ARB-lääkkeet, jos ACE-estäjät eivät sovi; munuaisensiirto ESRD-vaiheessa; kuulolaitteet; vuosittaiset silmä- ja audiologiset tarkastukset
COL4A5-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 6,5 kb geenin 257,7 kb:stä; 5 076 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä COL4A5
758
COL4A5-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 257,7 kb geenistä COL4A5, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 6,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
Geeniin COL4A5 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita COL4A5 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the digestive system
- Abnormal shape of the digestive system
- Abnormality of esophagus structure
- Esophageal tumor
- Poor swallowing
- Achalasia
- Acid reflux
- Hypoperistalsis
- Indigestion
Näytä 3 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). COL4A5-geeni: collagen type IV alpha 5 chain. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/col4a5
Dante Labs. COL4A5-geeni: collagen type IV alpha 5 chain [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/col4a5
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa