Gen
COL4A5
collagen type IV alpha 5 chain
- HGNC 2207↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000188153↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 1287↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- Xq22.3
- Koordinater
- Kromosom X: 108 439 838–108 697 545 (GRCh38)
- Exoner
- 53 exoner på 257,7 kb
- Protein
- 1 691 aminosyror
- Tidigare symboler
- ASLN, ATS
- MANE Select-transkript
- ENST00000328300.11NM_033380.3
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/col4a5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs COL4A5, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Alports syndrom
En sällsynt njursjukdom som kännetecknas av glomerulonefropati med hematuri som fortskrider till terminal njursvikt (ESRD). Den är ofta förknippad med sensorineural dövhet och i enstaka fall med ögonavvikelser.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 6 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
ACE-hämmare (ramipril, förstahandsval, helst innan proteinuri uppstår); ARB om ACE-hämmare inte tolereras; njurtransplantation vid ESRD; hörapparater; årlig ögonundersökning och audiologisk uppföljning
Så är COL4A5 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 6,5 kb av genens 257,7 kb, och 5 076 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av COL4A5
758
positioner i COL4A5 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 257,7 kb av COL4A5, inklusive introner, och inte bara de 6,5 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
Egenskaper kopplade till COL4A5
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som COL4A5 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the female genitalia
- Chronic kidney disease
- Glomerular basement membrane lamellation
- Kidney damage
- Multiple kidney cysts
- Renal failure
- Stage 5 chronic kidney disease
- Tumor of the vulva
Visa ytterligare 5 egenskaper
Abnormality of the digestive system
- Abnormal shape of the digestive system
- Abnormality of esophagus structure
- Esophageal tumor
- Poor swallowing
- Achalasia
- Acid reflux
- Hypoperistalsis
- Indigestion
Visa ytterligare 3 egenskaper
Abnormality of the eye
- Abnormality of the eye
- Anterior lenticonus
- Clouding of the lens of the eye
- Astigmatism
- Close sighted
- Corneal inflammation
- Retinal flecks
- Macular hole
Visa ytterligare 3 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). COL4A5-genen: collagen type IV alpha 5 chain. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/col4a5
Dante Labs. COL4A5-genen: collagen type IV alpha 5 chain [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/col4a5
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor