Gene
ABHD5
abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase
- HGNC 21396(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000011198(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 51099(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 3p21.33
- Coordinate
- Cromosoma 3: 43.690.938–43.722.725 (GRCh38)
- Esoni
- 7 esoni su 31,8 kb
- Proteina
- 349 amminoacidi
- Noto anche come
- CGI-58, NCIE2
- Trascritto MANE Select
- ENST00000644371.2NM_016006.6
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Malattia da accumulo lisosomiale
- Malattia da accumulo lisosomiale (altri tipi e tipo non specificato)
Uno di 59 geni collegati ad esso
Copre le malattie da accumulo lisosomiale senza un referto dedicato, come la malattia di Farber e altre patologie correlate ad ASAH1, le deficienze di prosaposina (PSAP), la deficienza multipla di solfatasi, le mucopolisaccaridosi di tipo IX e X e la malattia di Dorfman-Chanarin; l'ereditarietà varia a seconda del sottotipo, più spesso autosomica recessiva.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di ABHD5
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 5,3 kb dei 31,8 kb del gene; 1050 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge ABHD5
11
posizioni in ABHD5 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 31,8 kb di ABHD5, introni inclusi, non solo i 5,3 kb di esoni.
Tratti collegati a ABHD5
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che ABHD5 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene ABHD5: abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/abhd5
Dante Labs. Gene ABHD5: abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/abhd5
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