Geen
SCO1
synthesis of cytochrome C oxidase 1
- HGNC 10603↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000133028↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 6341↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 17p13.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 17: 10 672 474–10 697 533 (GRCh38)
- Eksonid
- 6 eksonit, ulatus 25,1 kb
- Valk
- 301 aminohapet
- Varasemad tähised
- SCOD1
- MANE Select transkript
- ENST00000255390.10NM_004589.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe SCO1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Primaarne mitokondriaalne haigus
- Mitokondriaalse hingamisahela kompleksi puudulikkus
Üks 61 sellega seotud geenist
Kompleksi I, II, III, IV või V isoleeritud puudulikkus, mida põhjustavad tuuma- või mitokondriaalsete geenide variandid. See võib mõjutada aju, lihaseid, südant, maksa ja teisi energiavajadusega elundeid.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Teadmine võib lõpetada diagnoosiotsingu ning suunata mõjutatud elundite jälgimist ja mitokondritele toksiliste ravimite vältimist.
Kuidas SCO1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 9,6 kb kogupikkusega 25,1 kb; neist 906 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse SCO1
9
kohad geenis SCO1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SCO1 25,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (9,6 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Jagab 1 haigust
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaJagab 1 haigust
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit deltaJagab 1 haigust
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilonJagab 1 haigust
- BCS1LBCS1 ubiquinol-cytochrome c reductase complex chaperoneJagab 1 haigust
- COA6cytochrome c oxidase assembly factor 6Jagab 1 haigust
- COA8cytochrome c oxidase assembly factor 8Jagab 1 haigust
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Jagab 1 haigust
- COX15cytochrome c oxidase assembly factor COX15Jagab 1 haigust
- COX16cytochrome c oxidase assembly factor COX16Jagab 1 haigust
- COX20cytochrome c oxidase assembly factor COX20Jagab 1 haigust
- COX6B1cytochrome c oxidase subunit 6B1Jagab 1 haigust
Geeniga SCO1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SCO1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Brain degeneration
- Brisk reflexes
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Loss of developmental milestones
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SCO1 geen: synthesis of cytochrome C oxidase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/sco1
Dante Labs. SCO1 geen: synthesis of cytochrome C oxidase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/sco1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast