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Gen

SYCP2L

synaptonemal complex protein 2 like

Resumen

Localización citogenética
6p24.2
Coordenadas
Cromosoma 6: 10.887.052–10.974.309 (GRCh38)
Exones
30 exones en 87,3 kb
Proteína
812 aminoácidos
También conocido como
dJ62D2.1, NO145
Símbolos anteriores
C6orf177
Transcrito MANE Select
ENST00000283141.11NM_001040274.3
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informe revisado relevante para este gen

  • Infertilidad femenina

    • Capacidad disminuida o ausente de una mujer para lograr la concepción.

      • 1 remitente de GenCC la clasifica como definitiva o fuerte

Estructura de SYCP2L

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Sitios conocidos que causan enfermedad
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 6, con un corchete donde se ubica SYCP2L. SYCP2L y 13 genes cercanos en el cromosoma 6, desde 10.430.681 hasta 11.430.680.Cromosoma 66p24.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2710,6 Mb10,8 Mb11 Mb11,2 Mb11,4 MbGCNT2: 10.492.223–10.629.377, hebra directaGCNT2C6orf52: 10.671.283–10.694.797, hebra inversaC6orf52PAK1IP1: 10.694.633–10.711.168, hebra directaPAK1IP1TMEM14C: 10.722.915–10.731.141, hebra directaTMEM14CTMEM14B: 10.747.695–10.866.590, hebra directaTMEM14B: 10.747.794–10.930.423, hebra directaMAK: 10.762.723–10.838.553, hebra inversaMAKGCM2: 10.873.223–10.882.041, hebra inversaGCM2SYCP2L: 10.887.052–10.974.309, hebra directaSYCP2LELOVL2: 10.980.742–11.044.446, hebra inversaELOVL2SMIM13: 11.093.820–11.138.733, hebra directaSMIM13KANGD1: 11.093.834–11.138.733, hebra directaKANGD1ERVFRD-1: 11.102.324–11.111.845, hebra inversaERVFRD-1NEDD9: 11.181.524–11.382.348, hebra inversaNEDD9Diagrama de SYCP2L: 30 exones en la hebra directa del cromosoma 6Exón 3: 1 sitio conocido que causa enfermedadExón 1: 10.887.052–10.887.135, 84 basesExón 2: 10.891.513–10.891.581, 69 basesExón 3: 10.893.867–10.894.004, 138 basesExón 4: 10.894.085–10.894.204, 120 basesExón 5: 10.898.011–10.898.115, 105 basesExón 6: 10.898.824–10.898.848, 25 basesExón 7: 10.902.677–10.902.762, 86 basesExón 8: 10.902.875–10.902.963, 89 basesExón 9: 10.906.020–10.906.054, 35 basesExón 10: 10.907.542–10.907.684, 143 basesExón 11: 10.910.148–10.910.200, 53 basesExón 12: 10.910.824–10.910.869, 46 basesExón 13: 10.912.673–10.912.765, 93 basesExón 14: 10.912.867–10.912.927, 61 basesExón 15: 10.924.496–10.924.641, 146 basesExón 16: 10.926.339–10.926.432, 94 basesExón 17: 10.927.240–10.927.367, 128 basesExón 18: 10.928.403–10.928.450, 48 basesExón 19: 10.930.370–10.930.514, 145 basesExón 20: 10.931.440–10.931.489, 50 basesExón 21: 10.935.058–10.935.187, 130 basesExón 22: 10.942.459–10.942.529, 71 basesExón 23: 10.942.677–10.942.746, 70 basesExón 24: 10.955.116–10.955.217, 102 basesExón 25: 10.956.136–10.956.242, 107 basesExón 26: 10.958.784–10.958.875, 92 basesExón 27: 10.961.305–10.961.404, 100 basesExón 28: 10.961.500–10.961.558, 59 basesExón 29: 10.963.782–10.963.843, 62 basesExón 30: 10.973.952–10.974.309, 358 bases1246810121416182022242628305′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 2,9 kb de los 87,3 kb del gen; 2439 de esas bases codifican la proteína.

Secuenciación de SYCP2L

2

posiciones en SYCP2L en las que ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico

Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultades para analizar.

Un genoma completo cubre los 87,3 kb de SYCP2L, incluidos los intrones, y no solo los 2,9 kb de exones.

Genes vinculados a las mismas afecciones

Rasgos asociados a SYCP2L

La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que SYCP2L puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.

Enlaces externos

Origen de estos datos

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
  • La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
  • ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
  • Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
  • Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen SYCP2L: synaptonemal complex protein 2 like. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/sycp2l

Vancouver

Dante Labs. Gen SYCP2L: synaptonemal complex protein 2 like [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/sycp2l

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