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Gene

SYCP2L

synaptonemal complex protein 2 like

Sintesi

Localizzazione citogenetica
6p24.2
Coordinate
Cromosoma 6: 10.887.052–10.974.309 (GRCh38)
Esoni
30 esoni su 87,3 kb
Proteina
812 amminoacidi
Noto anche come
dJ62D2.1, NO145
Simboli precedenti
C6orf177
Trascritto MANE Select
ENST00000283141.11NM_001040274.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curato rilevante per questo gene

  • Infertilità femminile

    • Ridotta o assente capacità di una donna di concepire.

      • 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte

Struttura di SYCP2L

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 6, con una parentesi dove si trova SYCP2L. SYCP2L e 13 geni nelle vicinanze sul cromosoma 6, da 10.430.681 a 11.430.680.Cromosoma 66p24.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2710,6 Mb10,8 Mb11 Mb11,2 Mb11,4 MbGCNT2: 10.492.223–10.629.377, filamento direttoGCNT2C6orf52: 10.671.283–10.694.797, filamento inversoC6orf52PAK1IP1: 10.694.633–10.711.168, filamento direttoPAK1IP1TMEM14C: 10.722.915–10.731.141, filamento direttoTMEM14CTMEM14B: 10.747.695–10.866.590, filamento direttoTMEM14B: 10.747.794–10.930.423, filamento direttoMAK: 10.762.723–10.838.553, filamento inversoMAKGCM2: 10.873.223–10.882.041, filamento inversoGCM2SYCP2L: 10.887.052–10.974.309, filamento direttoSYCP2LELOVL2: 10.980.742–11.044.446, filamento inversoELOVL2SMIM13: 11.093.820–11.138.733, filamento direttoSMIM13KANGD1: 11.093.834–11.138.733, filamento direttoKANGD1ERVFRD-1: 11.102.324–11.111.845, filamento inversoERVFRD-1NEDD9: 11.181.524–11.382.348, filamento inversoNEDD9Diagramma di SYCP2L: 30 esoni sul filamento diretto del cromosoma 6Esone 3: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 10.887.052–10.887.135, 84 basiEsone 2: 10.891.513–10.891.581, 69 basiEsone 3: 10.893.867–10.894.004, 138 basiEsone 4: 10.894.085–10.894.204, 120 basiEsone 5: 10.898.011–10.898.115, 105 basiEsone 6: 10.898.824–10.898.848, 25 basiEsone 7: 10.902.677–10.902.762, 86 basiEsone 8: 10.902.875–10.902.963, 89 basiEsone 9: 10.906.020–10.906.054, 35 basiEsone 10: 10.907.542–10.907.684, 143 basiEsone 11: 10.910.148–10.910.200, 53 basiEsone 12: 10.910.824–10.910.869, 46 basiEsone 13: 10.912.673–10.912.765, 93 basiEsone 14: 10.912.867–10.912.927, 61 basiEsone 15: 10.924.496–10.924.641, 146 basiEsone 16: 10.926.339–10.926.432, 94 basiEsone 17: 10.927.240–10.927.367, 128 basiEsone 18: 10.928.403–10.928.450, 48 basiEsone 19: 10.930.370–10.930.514, 145 basiEsone 20: 10.931.440–10.931.489, 50 basiEsone 21: 10.935.058–10.935.187, 130 basiEsone 22: 10.942.459–10.942.529, 71 basiEsone 23: 10.942.677–10.942.746, 70 basiEsone 24: 10.955.116–10.955.217, 102 basiEsone 25: 10.956.136–10.956.242, 107 basiEsone 26: 10.958.784–10.958.875, 92 basiEsone 27: 10.961.305–10.961.404, 100 basiEsone 28: 10.961.500–10.961.558, 59 basiEsone 29: 10.963.782–10.963.843, 62 basiEsone 30: 10.973.952–10.974.309, 358 basi1246810121416182022242628305′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,9 kb dei 87,3 kb del gene; 2439 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge SYCP2L

2

posizioni in SYCP2L in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 87,3 kb di SYCP2L, introni inclusi, non solo i 2,9 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
  • La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SYCP2L: synaptonemal complex protein 2 like. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/sycp2l

Vancouver

Dante Labs. Gene SYCP2L: synaptonemal complex protein 2 like [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/sycp2l

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