Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA

Gen

VANGL1

VANGL planar cell polarity protein 1

Shrnutí

Cytogenetická poloha
1p13.1
Souřadnice
Chromozom 1: 115 641 970–115 698 221 (GRCh38)
Exony
8 exonů na 56,3 kb
Protein
524 aminokyselin
Další názvy
STB2
Transkript MANE Select
ENST00000355485.7NM_138959.3
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Referenční genomGRCh38

Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen VANGL1. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je VANGL1 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 1, se závorkou u VANGL1. VANGL1 a 5 genů poblíž na chromozomu 1, od 115 170 096 do 116 170 095.Chromozom 11p13.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44115,2 Mb115,4 Mb115,6 Mb115,8 Mb116 MbNGF: 115 285 904–115 338 770, řetězec zpětnémNGFVANGL1: 115 641 970–115 698 221, řetězec dopřednémVANGL1CASQ2: 115 697 988–115 837 921, řetězec zpětnémCASQ2NHLH2: 115 836 377–115 843 917, řetězec zpětnémNHLH2SLC22A15: 115 976 310–116 072 747, řetězec dopřednémSLC22A15MAB21L3: 116 111 068–116 138 149, řetězec dopřednémMAB21L3Schéma VANGL1: 8 exonů na dopředném řetězci chromozomu 1Exon 5: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 1: 115 641 970–115 642 086, 117 bázíExon 2: 115 651 277–115 651 484, 208 bázíExon 3: 115 659 641–115 659 773, 133 bázíExon 4: 115 663 661–115 664 268, 608 bázíExon 5: 115 682 364–115 682 497, 134 bázíExon 6: 115 683 944–115 684 076, 133 bázíExon 7: 115 685 293–115 685 527, 235 bázíExon 8: 115 691 119–115 698 221, 7 103 bází123456785′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 8,7 kb z 56,3 kb genu; 1 575 těchto bází kódují protein.

Jak genetický test čte VANGL1

1

pozice v genu VANGL1, kterou ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.

Celý genom pokrývá všech 56,3 kb genu VANGL1, včetně intronů, nikoli jen 8,7 kb exonů.

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
  • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen VANGL1: VANGL planar cell polarity protein 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/vangl1

Vancouver

Dante Labs. Gen VANGL1: VANGL planar cell polarity protein 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/vangl1

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test