Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

VANGL1

VANGL planar cell polarity protein 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1p13.1
Koordinaadid
Kromosoom 1: 115 641 970–115 698 221 (GRCh38)
Eksonid
8 eksonit, ulatus 56,3 kb
Valk
524 aminohapet
Tuntud ka kui
STB2
MANE Select transkript
ENST00000355485.7NM_138959.3
Lookuse tüüp
Protein-coding
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni VANGL1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas VANGL1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub VANGL1. VANGL1 ja sellele lähedal asuvad 5 geeni kromosoomil 1, vahemikus 115 170 096 kuni 116 170 095.Kromosoom 11p13.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44115,2 Mb115,4 Mb115,6 Mb115,8 Mb116 MbNGF: 115 285 904–115 338 770, pöördne ahelNGFVANGL1: 115 641 970–115 698 221, otsene ahelVANGL1CASQ2: 115 697 988–115 837 921, pöördne ahelCASQ2NHLH2: 115 836 377–115 843 917, pöördne ahelNHLH2SLC22A15: 115 976 310–116 072 747, otsene ahelSLC22A15MAB21L3: 116 111 068–116 138 149, otsene ahelMAB21L3VANGL1 skeem: 8 eksonit kromosoomi 1 otsene ahelalEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 115 641 970–115 642 086, 117 alustEkson 2: 115 651 277–115 651 484, 208 alustEkson 3: 115 659 641–115 659 773, 133 alustEkson 4: 115 663 661–115 664 268, 608 alustEkson 5: 115 682 364–115 682 497, 134 alustEkson 6: 115 683 944–115 684 076, 133 alustEkson 7: 115 685 293–115 685 527, 235 alustEkson 8: 115 691 119–115 698 221, 7103 alust123456785′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 8,7 kb kogupikkusega 56,3 kb; neist 1575 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: VANGL1

1

VANGL1 positsioon, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.

Terve genoom katab kogu VANGL1 geeni 56,3 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 8,7 kb eksoneid.

Geeniga VANGL1 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida VANGL1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). VANGL1 geen: VANGL planar cell polarity protein 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/vangl1

Vancouver

Dante Labs. VANGL1 geen: VANGL planar cell polarity protein 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/vangl1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test