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Gène

VANGL1

VANGL planar cell polarity protein 1

Résumé

Localisation cytogénétique
1p13.1
Coordonnées
Chromosome 1 : 115 641 970–115 698 221 (GRCh38)
Exons
8 exons sur 56,3 kb
Protéine
524 acides aminés
Aussi appelé
STB2
Transcrit MANE Select
ENST00000355485.7NM_138959.3
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore VANGL1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de VANGL1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de VANGL1. VANGL1 et 5 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 115 170 096 à 116 170 095.Chromosome 11p13.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44115,2 Mb115,4 Mb115,6 Mb115,8 Mb116 MbNGF : 115 285 904–115 338 770, brin inverseNGFVANGL1 : 115 641 970–115 698 221, brin directVANGL1CASQ2 : 115 697 988–115 837 921, brin inverseCASQ2NHLH2 : 115 836 377–115 843 917, brin inverseNHLH2SLC22A15 : 115 976 310–116 072 747, brin directSLC22A15MAB21L3 : 116 111 068–116 138 149, brin directMAB21L3Schéma de VANGL1 : 8 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 115 641 970–115 642 086, 117 basesExon 2 : 115 651 277–115 651 484, 208 basesExon 3 : 115 659 641–115 659 773, 133 basesExon 4 : 115 663 661–115 664 268, 608 basesExon 5 : 115 682 364–115 682 497, 134 basesExon 6 : 115 683 944–115 684 076, 133 basesExon 7 : 115 685 293–115 685 527, 235 basesExon 8 : 115 691 119–115 698 221, 7 103 bases123456785′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 8,7 kb sur les 56,3 kb du gène ; 1 575 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de VANGL1

1

position de VANGL1 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 56,3 kb de VANGL1, introns compris, et pas seulement les 8,7 kb d'exons.

Traits associés à VANGL1

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que VANGL1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène VANGL1 : VANGL planar cell polarity protein 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/vangl1

Vancouver

Dante Labs. Gène VANGL1 : VANGL planar cell polarity protein 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/vangl1

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