Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

VANGL1

VANGL planar cell polarity protein 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
1p13.1
Koordinater
Kromosom 1: 115 641 970–115 698 221 (GRCh38)
Exoner
8 exoner på 56,3 kb
Protein
524 aminosyror
Även känd som
STB2
MANE Select-transkript
ENST00000355485.7NM_138959.3
Lokustyp
Protein-coding
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser VANGL1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är VANGL1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 1, med en parentes där VANGL1 finns. VANGL1 och 5 gener i närheten på kromosom 1, från 115 170 096 till 116 170 095.Kromosom 11p13.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44115,2 Mb115,4 Mb115,6 Mb115,8 Mb116 MbNGF: 115 285 904–115 338 770, bakåt-strängNGFVANGL1: 115 641 970–115 698 221, framåt-strängVANGL1CASQ2: 115 697 988–115 837 921, bakåt-strängCASQ2NHLH2: 115 836 377–115 843 917, bakåt-strängNHLH2SLC22A15: 115 976 310–116 072 747, framåt-strängSLC22A15MAB21L3: 116 111 068–116 138 149, framåt-strängMAB21L3Diagram över VANGL1: 8 exoner på framåt-strängen av kromosom 1Exon 5: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 115 641 970–115 642 086, 117 baserExon 2: 115 651 277–115 651 484, 208 baserExon 3: 115 659 641–115 659 773, 133 baserExon 4: 115 663 661–115 664 268, 608 baserExon 5: 115 682 364–115 682 497, 134 baserExon 6: 115 683 944–115 684 076, 133 baserExon 7: 115 685 293–115 685 527, 235 baserExon 8: 115 691 119–115 698 221, 7 103 baser123456785′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 8,7 kb av genens 56,3 kb, och 1 575 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av VANGL1

1

position i VANGL1 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.

En helgenomsekvensering täcker alla 56,3 kb av VANGL1, inklusive introner, och inte bara de 8,7 kb exoner.

Egenskaper kopplade till VANGL1

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som VANGL1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.17-8666dff2.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). VANGL1-genen: VANGL planar cell polarity protein 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/vangl1

Vancouver

Dante Labs. VANGL1-genen: VANGL planar cell polarity protein 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/vangl1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test