Gen
SLC16A1
solute carrier family 16 member 1
- HGNC 10922↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000155380↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6566↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 1p13.2
- Koordinater
- Kromosom 1: 112 911 847–112 956 196 (GRCh38)
- Exoner
- 5 exoner på 44,4 kb
- Protein
- 500 aminosyror
- Även känd som
- MCT, MCT1
- MANE Select-transkript
- ENST00000369626.8NM_003051.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc16a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SLC16A1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Hyperinsulinism
- Islet Cell AdenomatosisAutosomalt dominant
En sporadisk eller ärftlig sjukdom som kännetecknas av fokal eller diffus proliferation av cellerna i Langerhans öar i bukspottkörteln. Den leder till hyperinsulinemi och hypoglykemi.
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Onormalt höga nivåer av insulin i blodet.
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Egenskapsrapport för SLC16A1
Idrott och prestation
- Laktattransport
Så är SLC16A1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,8 kb av genens 44,4 kb, och 1 503 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SLC16A1
1Låg
Hur svår SLC16A1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av SLC16A1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.3,9 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.4,3 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
11
positioner i SLC16A1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 44,4 kb av SLC16A1, inklusive introner, inte bara de 3,8 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- GCKglucokinaseDelar 2 tillstånd
- GLUD1glutamate dehydrogenase 1Delar 2 tillstånd
- HADHhydroxyacyl-CoA dehydrogenaseDelar 2 tillstånd
- KCNJ11potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 11Delar 2 tillstånd
- ABCC8ATP binding cassette subfamily C member 8Delar 1 tillstånd
- FOXA2forkhead box A2Delar 1 tillstånd
- HK1hexokinase 1Delar 1 tillstånd
- INSRinsulin receptorDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SLC16A1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC16A1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SLC16A1-genen: solute carrier family 16 member 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc16a1
Dante Labs. SLC16A1-genen: solute carrier family 16 member 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc16a1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor